结论：酒店告知不满三个月扣一千是否合理，需根据具体情况判断，包括双方签订的合同内容、酒店的规定是否合法合规以及是否存在欺诈、胁迫等情形。以下从不同角度进行分析：
一、合同内容角度
合同约定：
- 如果双方在签订住宿合同时，合同中明确约定了“不满三个月扣一千”的条款，并且该条款是在双方平等、自愿、协商一致的基础上订立的，没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗，那么该条款是有效的。在这种情况下，酒店按照合同约定扣除一千元，从合同法的角度来看，是合理的。
格式条款：
- 如果“不满三个月扣一千”的条款是酒店单方面制定的格式条款，并且没有以显著方式提示消费者注意，或者没有按照消费者的要求对该条款进行说明，那么该条款可能因未履行提示或者说明义务而无效。此外，如果该格式条款存在免除酒店责任、加重消费者责任、排除消费者主要权利等情形，该条款也是无效的。在这种情况下，酒店扣除一千元就是不合理的。
二、酒店规定合法性角度
合法合规性：
- 酒店的规定必须合法合规，不能违反法律、行政法规的强制性规定。如果“不满三个月扣一千”的规定违反了相关法律法规，比如侵犯了消费者的合法权益，那么该规定就是无效的。酒店不能依据无效的规定扣除消费者的费用。
公平合理性：
- 即使酒店的规定在形式上合法合规，但如果该规定显失公平，比如扣除的费用过高，与消费者实际造成的损失不成比例，那么该规定也可能因显失公平而被撤销或变更。在这种情况下，酒店扣除一千元同样是不合理的。
三、特殊情形角度
欺诈、胁迫：
- 如果酒店在与消费者签订合同时存在欺诈、胁迫等情形，导致消费者在违背真实意思的情况下订立了合同，那么消费者有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该合同。合同被撤销后，酒店就不能依据合同中的“不满三个月扣一千”条款扣除消费者的费用。
消费者权益保护：
- 根据《消费者权益保护法》的相关规定，消费者享有公平交易的权利。如果酒店的规定侵犯了消费者的公平交易权，比如通过不合理的方式扣除消费者的费用，那么消费者有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
建议：
- 如果您认为酒店扣除一千元是不合理的，您可以先与酒店进行协商，要求酒店退还扣除的费用。
- 如果协商无果，您可以向当地的消费者协会或者相关行政部门投诉，寻求帮助和支持。
- 您也可以考虑通过法律途径解决纠纷，比如向人民法院提起诉讼或者申请仲裁。
后续行动：在处理此类纠纷时，建议您保留好相关证据，如合同、付款凭证、酒店规定等，以便在需要时提供证明。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。