公司辞退员工时，赔偿的不仅仅是基本工资，而是包括基本工资、绩效奖金等在内的应得工资总额，具体依据辞退的合法性及员工的工作年限、工资水平等因素来确定赔偿金额。以下是对这一问题的详细分析：
一、合法辞退与违法辞退的赔偿差异
合法辞退：
- 如果公司因员工严重违反规章制度、严重失职造成重大损害等合法原因辞退员工，且程序合法，那么公司通常不需要支付经济补偿金，但应结清员工应得的工资，包括基本工资和绩效奖金等。
违法辞退：
- 如果公司违法辞退员工，如无正当理由辞退、未提前通知等，那么公司需要支付经济赔偿金。经济赔偿金的计算通常基于员工的工作年限和工资水平，这里的“工资”包括基本工资、绩效奖金等应得收入。
二、赔偿金额的计算
经济补偿金（合法辞退但符合支付条件时）：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，经济补偿金按员工在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
- 这里的“月工资”是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，包括基本工资、绩效奖金等应得收入。
经济赔偿金（违法辞退时）：
- 经济赔偿金是经济补偿金的两倍，即按员工在本单位工作的年限，以每满一年支付两个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付一个月工资的经济赔偿。
- 同样，这里的“月工资”也是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
三、实际操作中的注意事项
工资构成：
- 在计算赔偿金额时，需要明确员工的工资构成，包括基本工资、绩效奖金、津贴补贴等，以确保赔偿金额的准确性。
证据收集：
- 员工在面临辞退时，应收集相关证据，如工资条、劳动合同、辞退通知等，以证明自己的工资水平和辞退的合法性或违法性。
协商与诉讼：
- 如果员工对公司辞退的赔偿金额有异议，可以与公司进行协商。协商不成的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
举例说明：假设某员工在公司工作了3年，月平均工资（包括基本工资和绩效奖金）为8000元。如果公司合法辞退该员工且符合支付经济补偿金的条件，那么公司应支付的经济补偿金为3个月×8000元/月=24000元。如果公司违法辞退该员工，那么公司应支付的经济赔偿金为2倍×24000元=48000元。
总结来说，公司辞退员工时，赔偿的不仅仅是基本工资，而是包括基本工资、绩效奖金等在内的应得工资总额。具体赔偿金额需根据辞退的合法性、员工的工作年限和工资水平等因素来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。