您好，关于资质条件设为加分项是否违法的问题，这需要根据具体的资质类型、项目性质以及相关法律法规来综合判断。

首先，对于企业依法必须招标的项目，根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》及相关规定，招标人不得以不合理的条件限制、排斥潜在投标人或者投标人。特别是，依法必须招标项目不得提出注册地址、所有制性质、市场占有率、特定行政区域或者特定行业业绩、取得非强制资质认证等要求作为资格条件。以ISO9001质量管理体系认证为例，它虽然是一个国际通用标准，但并不属于国家强制资质认证。因此，在依法必须招标的项目中，不可以将ISO9001质量管理体系认证作为资格条件。然而，如果根据招标项目的特点和实际需求，该认证与履行合同具有关联性，那么可以将其设定为加分项。但需要注意的是，在政府采购公开招标项目中，根据财政部的最新监管信息，ISO9001质量管理体系认证不得作为资格条件或加分项，以避免构成差别歧视待遇。

其次，对于非依法必须招标的项目，通常没有禁止性规定，企业可以根据自身需求和项目特点，将相关资质条件设定为资格条件或加分项。但同样需要确保这些资质条件与项目实际需求相关联，且不构成对潜在投标人的不合理限制或排斥。

此外，还有一些特定的资质条件，如计算机信息系统集成企业资质、城市园林绿化企业资质、物业服务企业资质等，这些资质在国家“放管服”改革背景下已经被取消或不再作为行政许可事项管理。因此，在政府采购或企业招标项目中，这些已经取消的资质条件不得再作为资格条件或加分项。

综上所述，资质条件设为加分项是否违法，需要根据具体资质类型、项目性质以及相关法律法规来综合判断。在设定资质条件时，企业应确保与项目实际需求相关联，且不构成对潜在投标人的不合理限制或排斥。同时，应密切关注相关法律法规的更新和变化，以确保招标活动的合法性和合规性。如果您有更具体的资质条件或项目情况需要咨询，请随时告知，我将为您提供更详细的解答。