在合同纠纷中，若原告提交了多家修复报价单但被告不认可赔偿金额，关于司法鉴定费用的承担问题，通常遵循以下原则：

1. 鉴定费用承担的一般原则：

   • 在诉讼过程中，鉴定费用一般由申请鉴定的一方先行垫付。这是基于诉讼程序中的常规操作，即谁主张、谁举证的原则延伸而来。若原告为了证明其主张的赔偿金额合理，申请了司法鉴定，那么原告通常需要先行支付鉴定费用。

2. 鉴定结果对费用承担的影响：

   • 若鉴定结果支持原告主张：即鉴定出的修复费用与原告提交的报价单相近或一致，那么鉴定费用通常会被视为原告为证明其主张而支出的合理费用，最终可能由败诉方（即被告）承担。这是因为被告不认可原告的赔偿金额，导致原告不得不通过司法鉴定来证明其主张，由此产生的费用应由被告承担。
   • 若鉴定结果不支持原告主张：即鉴定出的修复费用远低于原告提交的报价单，那么鉴定费用可能由原告自行承担。这是因为原告未能充分证明其主张的赔偿金额合理性，导致鉴定费用成为不必要的支出。

3. 特殊情况下的费用承担：

   • 如果双方在合同中明确约定了鉴定费用的承担方式，那么应按照合同约定执行。合同是双方意思自治的体现，具有法律约束力。
   • 如果鉴定费用的产生是由于被告的过错或违约行为导致的，例如被告故意拖延时间、提供虚假信息等，导致原告不得不申请司法鉴定，那么鉴定费用可能由被告承担。

4. 实际操作中的建议：

   • 在诉讼前，双方可以尝试通过协商、调解等方式解决纠纷，以避免不必要的鉴定费用支出。
   • 如果确实需要申请司法鉴定，双方可以在申请前明确鉴定费用的承担方式，并在鉴定协议中予以约定，以减少后续争议。
   • 在诉讼过程中，双方应积极配合鉴定工作，提供真实、完整的证据材料，以确保鉴定结果的准确性和公正性。

举例说明：假设在一个房屋修复合同纠纷中，原告提交了三家修复公司的报价单，总金额为10万元。被告认为报价过高，不认可该赔偿金额。原告随后申请了司法鉴定，鉴定结果为修复费用为8万元。在此情况下，由于鉴定结果支持了原告的主张（尽管金额有所降低），但考虑到原告是为了证明其主张而支出的鉴定费用，且该费用是合理的，因此鉴定费用可能由被告承担。当然，具体承担方式还需根据法院的判决和双方的具体情况来确定。

总结来说，司法鉴定费用的承担问题需要根据鉴定结果、合同约定以及双方的行为来综合判断。在合同纠纷中，双方应尽可能通过协商、调解等方式解决争议，以减少不必要的费用支出。如果确实需要申请司法鉴定，建议双方在申请前明确费用承担方式，并在诉讼过程中积极配合鉴定工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。