结论：男方起诉要求女方支付抚养费，女方是否需要支付需分情况讨论，关键在于双方协议的效力以及是否符合法律规定。以下为具体分析：

1. 关于未办理结婚证的法律性质
   双方未办理结婚登记，属于同居关系而非婚姻关系。根据《民法典》及相关司法解释，同居期间所生子女与婚生子女享有同等权利，父母均有抚养义务。因此，男方起诉要求女方支付抚养费在法律上有依据，子女抚养义务不因父母是否登记结婚而免除。

2. 关于分居协议的效力
   若双方曾签订书面协议明确约定“女方无需支付抚养费”，需分两种情况判断：

   • 若协议内容不损害子女利益：例如男方经济能力足以独立抚养子女，且子女实际生活未受影响，法院可能尊重双方约定，驳回男方诉求。
     
   • 若协议损害子女利益：例如男方经济状况恶化，或子女实际需求增加（如教育、医疗费用上升），法院可能以“抚养费是法定义务，不得通过协议免除”为由，支持男方诉求，要求女方支付抚养费。

3. 关于抚养费的具体认定
   即使法院判决女方支付抚养费，金额也需结合以下因素确定：

   • 子女的实际需求（如生活费、教育费、医疗费等）；
     
   • 父母双方的经济能力（收入、财产状况）；
     
   • 当地生活水平。
     若女方确无支付能力（如失业、重大疾病等），法院可能酌情减少或暂缓支付，但不会完全免除义务。

4. 实务建议

   • 女方应对策略：
     
     1. 收集分居协议原件，证明双方曾达成一致；
        
     2. 提供男方经济状况证据（如收入证明、财产状况），证明其有能力独立抚养；
        
     3. 若自身经济困难，准备相关证明（如失业证明、医疗记录），争取减免抚养费。
        
   • 男方诉讼风险：若无法证明子女需求增加或女方有能力支付，可能面临败诉风险。

总结：女方是否需要支付抚养费，需以“子女利益是否受损”为核心判断标准。若协议未损害子女利益，女方可能无需支付；若子女实际需求无法满足，女方仍需履行抚养义务。建议双方优先协商，若协商不成，可委托律师介入处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询。