国有土地权转让究竟属于行政案件还是民事案件，这并非一个简单的是非问题，而是需要根据具体情况进行综合判断。以下是对此问题的详细解答：
一、一般情况下的民事性质
在大多数情况下，国有土地使用权的转让活动被视为民事行为。这通常发生在土地使用权的出让方（由国家土地管理部门代表）与受让方（如企业、个人等民事主体）之间。双方基于平等自愿、等价有偿的原则，就土地使用权的转让事宜进行协商并签订协议。此类协议主要围绕土地这一财产权益进行交易，目的在于设立、变更、终止民事权利义务关系。因此，在这种情况下，国有土地转让协议更符合民事合同的特征，原则上应适用民事法律规范进行调整。若因此产生争议，通常通过民事诉讼途径解决。
二、特殊情况下的行政性质
然而，也存在一些特殊情况，使得国有土地转让协议可能被认定为行政协议。这主要发生在以下情形：
行政目的明确：当协议的签订是基于行政机关行使行政管理职权，旨在实现行政管理或公共服务目标时，该协议可能具有行政性质。
行政优益权的存在：如果协议内容包含行政机关基于行政管理职能所享有的特殊权力，如监督、指挥、单方变更或解除协议等，这也表明该协议可能属于行政协议。
特定法律依据：根据我国《土地管理法》及《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》，特定情形下的国有土地使用权转让协议，如矿业权等国有自然资源使用权出让协议，明确被纳入行政协议的范围。
在特定情况下，如土地收储后再转让过程中，若行政机关出于城市规划、公共利益等行政目的与相对人签订转让协议，且该协议带有明显的行政属性，则应认定为行政协议。此时，若因此产生争议，应通过行政诉讼途径解决。
三、综合判断与法律适用
具体判断国有土地转让协议的性质，需综合考虑协议的具体内容、签订背景、双方的权利义务设置以及法律法规的规定等多方面因素。若协议被认定为民事协议，则主要适用民法相关规定；若被认定为行政协议，则受行政法的规范和调整。
四、建议与操作
在实际操作中，对于国有土地转让协议的性质判断，建议咨询专业律师或法律机构，以确保正确适用法律规范并妥善处理相关争议。同时，在签订协议时，双方应明确协议的性质、目的、权利义务等关键条款，以避免后续的法律纠纷。
综上所述，国有土地权转让的性质并非一成不变，而是需根据具体情况进行综合判断。希望以上解答能对您有所帮助。