结论：员工工资从老板一个公司转入老板另一个公司是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论。

1. 如果两个公司之间存在合法的关联交易或资金调配，且工资支付符合劳动合同和相关法律规定

• 法律背景：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果老板的两个公司之间存在合法的关联关系，比如母公司与子公司、总公司与分公司等，且这种资金调配是出于合法的经营需要，同时工资支付也符合劳动合同的约定和相关法律规定，那么这种工资支付方式并不违法。
• 建议：在这种情况下，员工可以确认自己的工资是否按时足额支付，以及劳动合同中的相关条款是否得到遵守。如果一切正常，那么无需担心违法问题。

2. 如果两个公司之间不存在合法的关联交易或资金调配，或者工资支付违反了劳动合同和相关法律规定

• 法律背景：如果老板试图通过将工资从一个公司转入另一个公司来逃避法律责任，比如逃避社保缴纳、个税缴纳等，或者这种资金调配没有合法的经营需要作为依据，那么这种行为可能构成违法。特别是如果这种行为导致员工的工资被拖欠、克扣或者未按照劳动合同约定支付，那么员工有权依法维护自己的权益。
• 可能后果：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条和第四十六条的规定，如果用人单位未及时足额支付劳动报酬，劳动者可以解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。此外，如果这种行为还涉及偷税漏税等违法行为，那么还可能面临税务部门的处罚。
• 建议：在这种情况下，员工可以首先与用人单位进行协商，要求按照劳动合同约定支付工资。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

3. 特殊情况：公司合并、分立或转让等

• 法律背景：在公司合并、分立或转让等情况下，员工的劳动关系和工资支付可能会受到影响。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条的规定，用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。因此，在这种情况下，工资支付应当由承继权利和义务的用人单位负责。
• 建议：如果员工遇到公司合并、分立或转让等情况，应当及时了解自己的劳动关系和工资支付情况，并与新的用人单位进行沟通确认。如果新的用人单位拒绝支付工资或者存在其他违法行为，员工可以依法维护自己的权益。

总结与进一步思考：员工工资从老板一个公司转入老板另一个公司是否违法，取决于多个因素，包括两个公司之间的关系、资金调配的合法性、工资支付是否符合劳动合同和相关法律规定等。因此，在遇到这种情况时，员工应当保持警惕，及时了解自己的权益情况，并在必要时寻求法律帮助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。