船员超过合同期后的工资计算，需根据具体情况分情况讨论，核心结论如下：

1. 合同有明确约定
   若劳动合同或集体协议中明确约定了“超期服务条款”（如合同期满后继续工作的工资标准、服务期限等），则直接按约定执行。例如：

   • 约定“超期期间工资按原工资的1.5倍计算”；
     
   • 约定“超期服务视为自动续约，工资标准不变”。
     法律依据：根据《劳动合同法》第35条，劳动合同内容需双方协商一致，书面变更后生效。若合同已明确约定，双方均需遵守。

2. 合同无约定，但船员继续提供劳动
   若合同未约定超期服务条款，但船员实际继续工作，此时可能构成“事实劳动关系”，工资计算需分两步：

   • 原合同期满至超期期间：船员有权要求按原合同工资标准支付报酬；
     
   • 超期后：若双方未续签合同，但船员继续工作，用人单位需支付双倍工资差额（自超期次月起计算，最长不超过11个月），同时原工资标准仍需支付。
     法律依据：根据《劳动合同法》第82条，用人单位未及时续签合同，需支付双倍工资；根据《民法典》第119条，事实劳动关系下，劳动者有权要求按原标准支付报酬。

3. 超期服务因用人单位原因导致
   若超期服务是由于用人单位未安排船员离船、未办理离职手续等原因导致，船员除要求支付工资外，还可主张：

   • 额外补偿：如因超期服务产生的额外费用（交通费、住宿费等）；
     
   • 经济补偿金：若用人单位违法解除劳动关系，需按工作年限支付经济补偿（每满1年支付1个月工资）。
     法律依据：根据《劳动合同法》第46条、第47条，用人单位违法解除或未提供劳动条件，需支付经济补偿。

实务建议：

• 船员应保留超期服务期间的证据（如考勤记录、工作邮件、同事证言等），以证明实际工作情况；
  
• 若用人单位拒绝支付超期工资，可先通过协商、投诉（向劳动监察部门）解决，必要时申请劳动仲裁；
  
• 涉及国际航行船舶的，还需注意适用法律（如中国法或船旗国法）及国际公约（如MLC公约）的特殊规定。
  

如有具体合同条款或超期细节，可进一步向我说明，我会结合实际情况为您详细分析。