结论：合同中虽然明确了履约保证金，但双方仍然可以通过协商一致的方式决定不收取该保证金。不过，是否收取还需考虑合同的具体条款、双方协商情况以及相关法律法规的规定。
详细分析：
合同条款的约定：
- 合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。如果合同中明确约定了履约保证金的支付条款，那么原则上双方应当按照合同约定履行。但这并不意味着合同条款不可变更或协商。
- 在合同履行过程中，如果双方认为收取履约保证金不再必要或存在其他更合适的担保方式，可以通过协商一致的方式修改合同条款，从而不收取履约保证金。
双方协商的情况：
- 合同的履行往往受到多种因素的影响，包括市场环境的变化、双方经济状况的改变等。因此，在合同履行过程中，双方可能会根据实际情况对合同条款进行协商和调整。
- 如果双方能够就履约保证金的收取问题达成一致意见，并且这种变更不违反法律法规的强制性规定，那么不收取履约保证金是可行的。
相关法律法规的规定：
- 在考虑是否收取履约保证金时，还需要关注相关法律法规的规定。例如，某些行业或领域可能对履约保证金的收取有特定的规定或限制。
- 如果法律法规对履约保证金的收取有明确要求或禁止性规定，那么双方必须遵守这些规定，不能随意变更或免除。
法律建议：
- 审查合同条款：首先，建议双方仔细审查合同中关于履约保证金的条款，明确双方的权利和义务。
- 协商沟通：如果双方认为不收取履约保证金更为合适，可以通过协商沟通的方式达成一致意见，并考虑签订补充协议或修改原合同条款。
- 关注法律法规：在协商过程中，双方应关注相关法律法规的规定，确保不收取履约保证金的决定不违反法律法规的强制性规定。
- 保留证据：无论双方最终决定是否收取履约保证金，都应保留好相关证据和文件，以备不时之需。
可能后果：
- 如果双方协商一致不收取履约保证金，并且这种变更不违反法律法规的强制性规定，那么合同可以继续履行，双方不会因此产生法律纠纷。
- 如果一方未经对方同意擅自不收取履约保证金，可能构成违约行为，需要承担相应的法律责任。
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