针对您提出的“旅馆停业整顿期间擅自经营怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、明确结论
旅馆在停业整顿期间擅自经营是违法的，将面临一系列严厉的法律处罚及后果，包括但不限于行政处罚、信用受损，甚至可能面临刑事责任。
二、行政处罚措施
警告与责令整改：
- 行政机关在发现旅馆擅自经营后，会首先给予书面警告，并责令其立即停止非法营业活动，进行整改。
罚款：
- 根据违法情节的严重程度，旅馆将被处以相应金额的罚款。罚款的具体数额会依据相关法律法规和地方规定来确定，可能高达数万元或更多。
没收违法所得和非法财物：
- 旅馆在停业整顿期间通过擅自经营所获得的收入及用于违法经营的财物，将被行政机关依法没收。
吊销营业执照或许可证：
- 对于严重违法行为，特别是那些涉及公共安全、卫生等领域的违规行为，行政机关将吊销旅馆的营业执照或许可证，剥夺其合法经营资格。
延长停业整顿期限或强制执行：
- 若旅馆拒不改正违法行为，行政机关不仅有权延长其停业整顿期限，还可能申请人民法院强制执行，确保处罚决定得到落实。
三、其他后果
信用受损：
- 旅馆的违规行为将被记录在信用档案中，对其市场信誉造成严重影响。这将影响旅馆未来的商业合作、银行贷款、市场准入等方面。
刑事责任：
- 在特定情况下，如因擅自经营导致重大安全事故、危害公众健康等严重后果，相关责任人可能触犯刑法，面临有期徒刑等刑事处罚。行政机关在发现涉嫌犯罪的行为时，将及时向公安机关移送案件。
四、建议与总结
- 合规经营：旅馆在停业整顿期间应严格遵守相关法律法规和行政机关的决定，确保不擅自经营。这是维护市场秩序、保障公共安全以及避免法律后果的基本要求。
- 加强管理：旅馆应加强内部管理，建立健全的合规制度，确保员工了解并遵守相关法律法规和规章制度。
- 及时沟通：如旅馆对停业整顿决定有异议或需要延长整顿期限等特殊情况，应及时与行政机关沟通并寻求合法途径解决。
综上所述，旅馆在停业整顿期间擅自经营将面临严重的法律后果。因此，我强烈建议旅馆经营者严格遵守相关法律法规和行政机关的决定，确保合法合规经营。