核心结论：当竣工备案表和土地权利主体不符时，需要分情况处理，关键在于明确不符的原因，通过合法途径纠正错误或完善手续，以保障相关权益并避免法律风险。以下是具体分析：

1. 核实不符原因

首先，需要核实竣工备案表与土地权利主体不符的具体原因。可能的原因包括：

• 登记错误：土地权利主体在登记时出现错误，导致备案表与实际权利人不一致。
• 权利转让未更新：土地权利已经转让，但未及时更新土地登记或竣工备案信息。
• 历史遗留问题：由于历史原因，土地权利主体与备案信息存在不一致。
• 其他特殊情况：如土地分割、合并或权利主体变更等未及时办理相关手续。

2. 根据原因采取相应措施

（1）登记错误

• 申请更正登记：如果发现是土地登记错误，应向当地不动产登记机构申请更正登记，提交相关证明材料（如土地权属证书、身份证明、错误登记的证明等），以纠正登记信息。
• 协调相关部门：在申请更正登记过程中，可能需要与规划、建设等部门协调，确保竣工备案信息与土地登记信息一致。

（2）权利转让未更新

• 办理权利转让手续：如果土地权利已经转让，但未更新登记信息，应尽快办理土地权利转让手续，包括签订转让合同、缴纳相关税费、申请变更登记等。
• 更新竣工备案信息：在土地权利转让手续完成后，向建设主管部门申请更新竣工备案信息，确保与土地登记信息一致。

（3）历史遗留问题

• 查阅历史档案：对于历史遗留问题，应查阅相关历史档案，了解土地权利主体的变更过程，收集相关证明材料。
• 申请确认权利：根据历史档案和证明材料，向当地政府或相关部门申请确认土地权利主体，并办理相应的登记手续。
• 协调解决争议：如果历史遗留问题涉及多方利益，可能需要通过协商、调解或诉讼等方式解决争议，明确土地权利主体。

（4）其他特殊情况

• 根据具体情况处理：对于土地分割、合并或权利主体变更等特殊情况，应根据具体法律法规和政策要求，办理相应的手续和登记。
• 咨询专业律师：在处理复杂情况时，建议咨询专业律师，以确保手续合法、合规，避免法律风险。

3. 注意事项

• 及时处理：发现竣工备案表与土地权利主体不符时，应及时处理，避免问题扩大或引发法律纠纷。
• 保留证据：在处理过程中，应保留好相关证明材料和沟通记录，以备不时之需。
• 遵守法律法规：在处理过程中，应严格遵守相关法律法规和政策要求，确保手续合法、合规。

温馨提示：如果您在处理竣工备案表与土地权利主体不符的问题时遇到困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。