针对您提出的问题，在自建房申请批下来后，弟弟表示他未来会建造，而您目前想先进行建造，这种情况下，确实建议您先与弟弟签订一份协议。以下是我为您详细分析的原因及建议：
一、签订协议的必要性
明确权益：通过签订协议，可以明确您和弟弟在宅基地及房屋建造上的各自权益，包括建造顺序、资金投入、产权归属等，避免未来可能出现的纠纷。
法律保障：协议作为法律文件，具有法律效力。一旦发生争议，协议可以作为解决纠纷的重要依据，保护双方的合法权益。
规划清晰：协议中可以明确建造的时间表、步骤和责任分配，有助于双方更好地规划建造过程，确保建造工作的顺利进行。
二、协议内容建议
建造顺序：明确您先进行建造，弟弟在未来某个时间点进行建造。
资金投入：如果建造过程中需要双方共同出资，协议中应明确各自出资的比例和方式。
产权归属：明确房屋建造完成后，产权的归属情况。如果未来房屋需要共同使用或分割，协议中应提前约定好相关事宜。
建造标准：如果双方对建造标准有不同要求，协议中应明确各自的责任和范围，确保建造质量符合双方期望。
违约责任：协议中应明确如果一方违反协议约定，应承担的违约责任和赔偿方式。
三、签订协议的注意事项
双方自愿：协议的签订应基于双方自愿的原则，任何一方不得强迫另一方签订。
合法合规：协议内容应符合相关法律法规的规定，不得违反国家强制性规定。
书面形式：协议应以书面形式签订，并由双方签字或盖章确认，以确保协议的法律效力。
妥善保管：签订后的协议应妥善保管，以备未来可能出现的争议时使用。
四、其他建议
咨询专业人士：在签订协议前，建议您咨询律师或相关法律专业人士的意见，以确保协议的合法性和有效性。
与村委会沟通：在建造过程中，建议您与村委会保持密切沟通，及时了解相关政策和规定，确保建造工作的合规性。
综上所述，签订一份详细的协议对于明确您和弟弟在自建房上的权益和责任至关重要。希望以上建议能对您有所帮助。