公司因自身过错对员工罚款一般不合法，但存在特殊情况。以下从不同角度进行分析：
- 从劳动法律法规角度
- 根据我国现行劳动法律法规，公司并非行政执法机关，不具有罚款的行政处罚权。劳动法等相关法律主要侧重于保障劳动者的合法权益，规范用人单位与劳动者之间的劳动关系。公司以自身过错为由对员工进行罚款，这种行为缺乏明确的法律依据，在法律性质上属于公司自行设定的处罚措施，是不被法律认可的。
- 例如，如果公司因为自身管理不善导致货物丢失，却将责任归咎于员工并对其罚款，这种做法违反了劳动法律法规中关于用人单位不得随意克扣劳动者工资的规定。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，公司无权以不合理的理由进行扣除。
- 从劳动合同和规章制度角度
- 即使公司在劳动合同或者内部规章制度中约定了因公司过错可以对员工罚款的条款，这种条款也可能因违反法律的强制性规定而无效。因为劳动法律法规对于涉及劳动者切身利益的事项，如工资、工作时间、休息休假等，都有明确的强制性规定，用人单位的规章制度和劳动合同约定不得与之相抵触。
- 不过，如果公司的规章制度是经过民主程序制定（如经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定），并且已经向劳动者公示或者告知，同时该罚款规定并不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，在某些特殊情况下，可能会被认定为有效。但这种情况非常少见，且对于“特殊情况”的认定标准非常严格，实践中很难满足。例如，如果员工的行为严重违反了公司的核心安全规定，且该规定与保障公司正常运营和员工生命安全密切相关，同时罚款金额合理，可能会得到一定程度的认可，但这种情况也存在较大争议。
- 从实际处理角度
- 如果公司对员工进行了不合理的罚款，员工可以通过多种途径维护自己的合法权益。首先，员工可以与公司进行协商，要求公司撤销罚款决定并返还被扣除的款项。如果协商不成，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对公司的违法行为进行查处，并责令公司改正。此外，员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径解决争议。
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