劳动者签署离职协议后申请仲裁，不必然应当承担违约责任，是否承担违约责任需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
离职协议的合法性与有效性：
- 如果离职协议是双方真实意思表示，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议是合法有效的。在此情况下，如果劳动者违反协议中的约定（如竞业限制、保密义务等），则可能需要承担违约责任。
- 如果离职协议存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，导致劳动者在违背真实意思的情况下签署，那么该协议可能被认定为无效或可撤销。在此情况下，劳动者申请仲裁通常不会被视为违约，也无需承担违约责任。
劳动者申请仲裁的内容与离职协议的关系：
- 如果劳动者申请仲裁的内容与离职协议无关，例如主张未支付的工资、加班费、经济补偿等，那么这些主张是基于劳动法律法规的规定，与离职协议的履行无关，因此劳动者无需承担违约责任。
- 如果劳动者申请仲裁的内容涉及离职协议的履行问题，如主张协议中的某些条款不合法或不合理，要求变更或撤销，那么这需要根据具体情况来判断。如果劳动者的主张成立，且离职协议因此被变更或撤销，那么劳动者无需承担违约责任；如果劳动者的主张不成立，且其违反了离职协议的约定，那么可能需要承担违约责任。
违约责任的承担方式：
- 如果劳动者确实需要承担违约责任，那么违约责任的承担方式通常包括支付违约金、赔偿损失等。具体承担方式需根据离职协议的约定以及劳动法律法规的规定来确定。
- 需要注意的是，即使离职协议中约定了违约金条款，该条款也不一定完全有效。根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定的违约金条款通常仅限于服务期和竞业限制两种情形。如果离职协议中的违约金条款超出了这两种情形，那么该条款可能被认定为无效。
法律建议：
- 对于劳动者而言，在签署离职协议前应仔细阅读协议内容，确保自己的权益得到充分保障。如果对协议中的某些条款存在疑问或异议，应及时与用人单位沟通协商，必要时可寻求法律帮助。
- 如果劳动者在签署离职协议后发现协议存在不合法或不合理之处，或者用人单位未按照协议约定履行义务，劳动者可以依法申请仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果劳动者因违反离职协议而需要承担违约责任，那么其可能面临支付违约金、赔偿损失等法律后果。
- 如果劳动者申请仲裁或提起诉讼并获得支持，那么其可能获得相应的经济补偿或赔偿，同时离职协议中的相关条款也可能被变更或撤销。
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