结论：民房办加工厂且已办理营业执照和税务登记，其合法性不能一概而论，需结合具体情形判断，以下分情况说明：

1. 若民房性质及用途符合规定
   根据《民法典》及各地关于房屋用途的规定，若民房产权证上登记的用途为“商业”或“工矿仓储”，或经规划、房管部门批准变更为经营性用途，且加工厂的经营范围不涉及污染、噪音、安全隐患等禁止性事项（如危险化学品生产），则办理营业执照和税务登记后，该加工厂具备合法经营资格。
   关键点：需核实民房产权证用途、是否完成用途变更审批、经营项目是否符合当地产业政策。

2. 若民房性质为住宅且未变更用途
   若民房产权证登记用途为“住宅”，且未通过规划、房管部门批准变更为商业用途，则直接用于开办加工厂可能违反《民法典》中“住宅不得擅自改变为经营性用房”的规定，以及《市场主体登记管理条例》中“经营场所需与产权证明一致”的要求。此时，即使办理了营业执照和税务登记，也可能因“经营场所不合法”被行政处罚（如责令停业、罚款），甚至影响合同效力（如与员工、客户的合同可能因主体不适格被认定无效）。
   例外情形：部分地区允许“住改商”但需满足条件（如经利害关系业主同意、符合消防安全标准等），需具体查询当地政策。

3. 其他合规风险
   即使民房用途合法，加工厂仍需满足以下条件：

   • 环保要求：若产生废水、废气、噪音等，需通过环保审批并取得排污许可证；
     
   • 消防安全：需符合《消防法》关于经营场所的消防标准，否则可能被责令整改或停业；
     
   • 税务合规：需按实际经营情况申报纳税，否则可能面临税务稽查及处罚。
     

建议：

1. 立即核查民房产权证用途及是否完成用途变更审批；
   
2. 咨询当地市场监管、规划、环保部门，确认加工厂的经营项目是否被允许在民房内开展；
   
3. 完善环保、消防等手续，确保经营合法合规。
   

若有进一步疑问（如具体地区的政策、手续办理流程），可直接向我咨询，我会结合您所在省份的法规详细解答。