针对“超过时效的案件怎么进行对抗”这一问题，核心结论是：超过诉讼时效的案件，被告方可以提出诉讼时效抗辩，但原告方仍可通过证明时效中断、中止或对方自愿履行等情形进行对抗。以下分情况详细说明：

1. 被告方提出诉讼时效抗辩
   根据《民法典》第一百九十二条，诉讼时效期间届满后，义务人可以提出不履行义务的抗辩。若被告明确主张“案件已过诉讼时效”，法院将依法审查时效期间是否届满。若确认超期且无法定例外情形，原告的诉讼请求将被驳回。此时，原告需重点应对被告的抗辩，而非单纯主张实体权利。

2. 原告方证明时效中断或中止

   • 时效中断：若原告能证明在时效期间内曾向被告主张权利（如发送律师函、提起诉讼等），或被告同意履行义务（如签署还款协议），时效将重新计算。例如，借款纠纷中，原告在时效届满前多次催款并留存书面证据，可中断时效。
     
   • 时效中止：若因不可抗力（如自然灾害、战争）或其他障碍（如原告丧失民事行为能力且无代理人）导致无法行使权利，时效在中止原因消除后继续计算。需注意，中止情形需发生在时效期间最后六个月内。

3. 被告自愿履行或放弃时效利益
   即使案件超期，若被告在诉讼中明确表示愿意履行义务（如口头承诺还款），或签署书面文件承认债务，视为放弃时效抗辩权。此时，法院不再主动审查时效问题，原告可据此主张权利。但需注意，被告的自愿履行需有明确意思表示，单纯协商或沉默不构成放弃。

4. 特殊情形下的时效延长
   部分法律对特定案件的时效有特殊规定。例如，国际货物买卖合同纠纷适用四年时效（《民法典》第五百九十四条）；环境污染损害赔偿请求权在知道损害后三年内提出，但自损害发生之日起超过二十年的不予保护。原告需核对案件是否属于此类特殊情形。

行动建议：

• 若您是原告，需立即梳理案件证据，重点查找时效中断、中止的证明材料（如催款记录、协议文本等），或尝试与被告协商获取书面履行承诺。
  
• 若您是被告，需在答辩期内明确提出时效抗辩，并附上时效计算依据（如合同签订时间、最后一次履行时间等）。
  
• 无论哪方，均需注意时效问题涉及复杂事实认定，建议提前准备完整证据链，必要时可委托律师协助分析。
  

如有具体案件细节需进一步探讨，可直接向我咨询。