结论：法院因有仲裁条款不受理案件后，另一案再受理是否有效，需根据具体情况判断。若两案涉及不同法律关系或事实，另一案受理可能有效；若两案实质相同，则另一案受理可能因违反“一事不再理”原则而无效。
分析说明：
仲裁条款的效力：
- 仲裁条款是双方当事人自愿将争议提交仲裁解决的书面协议，具有法律约束力。
- 根据《仲裁法》的相关规定，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。
另一案受理的有效性：
情况一：两案涉及不同法律关系或事实：
- 如果另一案与因仲裁条款而不受理的案件涉及不同的法律关系或事实，那么另一案的受理并不受仲裁条款的影响，可能是有效的。
- 例如，原案是合同纠纷，而另一案是侵权纠纷，两者涉及不同的法律关系和事实，因此另一案的受理是有效的。
情况二：两案实质相同：
- 如果另一案与因仲裁条款而不受理的案件在实质上是相同的，即涉及相同的法律关系和事实，那么另一案的受理可能因违反“一事不再理”原则而无效。
- “一事不再理”原则是指对已经发生法律效力的判决、裁定的案件，除法律另有规定外，不得就同一事实再行起诉和受理。虽然这一原则主要适用于判决和裁定，但在仲裁和诉讼的衔接中，也有类似的应用，即避免对同一争议进行重复处理。
实际操作中的考虑：
- 在实际操作中，法院在受理案件时，会审查案件是否涉及仲裁条款，以及另一案与原案的关系。
- 如果法院认为另一案与原案实质相同，且原案已因仲裁条款而不受理，那么法院可能会拒绝受理另一案，或者要求当事人先通过仲裁解决争议。
特殊场景：
- 如果仲裁条款存在无效情形（如一方在订立仲裁协议时缺乏相应的民事行为能力、仲裁协议对仲裁事项或仲裁委员会没有约定或约定不明确且双方达不成补充协议等），那么法院可以受理相关案件，此时另一案的受理也是有效的。
行动建议：
- 如果您面临类似情况，建议首先仔细审查仲裁条款的内容，确定其是否有效以及是否涵盖您想要提起诉讼的争议。
- 如果仲裁条款有效且涵盖相关争议，您可以考虑通过仲裁解决争议，或者咨询专业律师以寻求其他合法途径。
- 如果您认为另一案与原案在实质上不同，或者仲裁条款存在无效情形，您可以向法院提起诉讼，并准备好相关证据和法律依据以支持您的主张。
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