结论：父亲在世时签订的协议，在其过世后是否生效，主要取决于协议的性质、内容以及是否符合相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：
协议性质与内容：
- 如果协议是遗嘱：根据《中华人民共和国民法典》中关于继承的规定，遗嘱是遗嘱人对其遗产进行处分的法律行为，遗嘱在遗嘱人死亡时生效。因此，如果父亲在世时签订的是遗嘱，那么该遗嘱在其过世后生效，用于处理其遗产的分配。
- 如果协议是赠与合同：赠与合同是赠与人将自己的财产无偿给予受赠人，受赠人表示接受赠与的合同。赠与合同在双方意思表示一致时即成立并生效，但如果赠与的是不动产等需要办理登记手续的财产，则需在办理完相关登记手续后，赠与才发生法律效力。若父亲在世时签订的是赠与合同，且已满足生效条件，那么该合同在其过世后仍然有效，受赠人可以依据合同要求履行赠与。
- 如果协议是其他类型的合同：如买卖合同、租赁合同等，这些合同在双方意思表示一致且不违反法律法规的强制性规定时即成立并生效。父亲过世后，这些合同并不因其死亡而自动失效，除非合同中有特别约定或法律法规另有规定。合同的权利义务将由父亲的继承人继承或承担，具体取决于合同的性质和内容。
法律法规的规定：
- 除了上述根据协议性质和内容进行的判断外，还需要考虑相关法律法规的规定。例如，如果协议涉及的是夫妻共同财产，那么在父亲过世后，该财产的处理可能需要遵循《中华人民共和国民法典》中关于夫妻共同财产和继承的规定。
- 另外，如果协议中有违反法律法规强制性规定的内容，如限制他人婚姻自由、违反公序良俗等，那么这些内容将被视为无效，不影响协议其他部分的效力。
实际操作建议：
- 审查协议内容：首先，需要仔细审查父亲在世时签订的协议内容，明确其性质、目的和条款。
- 咨询专业律师：如果协议内容复杂或涉及大量财产，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。律师可以根据协议的具体内容和相关法律法规，为你提供详细的法律分析和建议。
- 办理相关手续：如果协议涉及不动产等需要办理登记手续的财产，应及时办理相关手续以确保协议的生效和履行。
总结与进一步思考：父亲在世时签订的协议在其过世后是否生效，取决于协议的性质、内容以及是否符合相关法律法规的规定。在处理这类问题时，建议仔细审查协议内容并咨询专业律师以获取准确的法律意见。如果你有具体的协议内容或相关情况需要咨询，可以直接向我提问，我会根据你的具体情况为你提供详细的法律分析和建议。