货物运输保险可以约定按照责任比例承担，但需满足特定条件且受法律限制。以下从不同角度详细分析：

1. 合同自由原则下的约定可能性
   根据《民法典》第四百六十五条，合同双方可在不违反法律强制性规定和公序良俗的前提下，自由约定权利义务。因此，若保险合同中明确约定“按责任比例承担赔偿责任”，且该条款不违反《保险法》等强制性规定，原则上具有法律效力。例如，若运输事故由多方过错导致（如托运人包装不当、承运人驾驶疏忽），合同可约定保险公司仅承担承运人责任范围内的赔付比例。

2. 法律对比例赔付的限制

   • 《保险法》第十九条：若保险条款通过比例赔付方式免除或减轻保险人依法应承担的义务（如故意或重大过失导致的损失），该条款可能被认定为无效。例如，若保险公司以“按责任比例”为由完全免除对承运人故意碰撞造成的损失的赔付责任，该约定无效。
     
   • 《保险法》第五十五条：若货物运输保险为定值保险（即保险价值已事先约定），保险公司应按约定价值全额赔付，不得以责任比例为由减少赔付金额。例如，双方约定货物价值为100万元，即使事故仅部分由承运人责任导致，保险公司仍需赔付100万元（除非存在免责事由）。

3. 比例赔付的合理适用场景

   • 多方责任共存时：若事故由托运人、承运人、第三方等多方过错导致，且合同明确约定“按各方责任比例分摊损失”，该约定可能被支持。例如，托运人未如实告知货物易燃性，承运人未采取防火措施，第三方引发火灾，此时可按过错比例分配赔付责任。
     
   • 保险金额低于实际价值时：若投保人未按货物实际价值足额投保（如货物价值100万元，仅投保50万元），保险公司可能按保险金额与实际价值的比例赔付（《保险法》第五十五条第四款）。但需注意，此处的“比例”是基于投保不足，而非责任比例。

4. 实务建议

   • 明确条款表述：若需约定比例赔付，应在合同中清晰界定“责任比例”的计算方式（如依据交通事故认定书、法院判决等），避免模糊表述导致争议。
     
   • 审查免责条款：确保比例赔付条款不涉及保险公司故意或重大过失免责，否则可能被认定无效。
     
   • 考虑定值保险：若货物价值波动较大或难以确定实际损失，建议选择定值保险以规避比例赔付风险。

总结：货物运输保险可约定比例赔付，但需以合同自由为前提，并严格遵守《保险法》关于条款效力、定值保险和赔付比例的限制。若您需进一步设计或审查保险合同条款，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。