在检察院阅卷时，司法鉴定报告只有电子版而没有纸质版，这一做法本身并不必然违法，但需满足一定条件。以下从多个角度进行分析：

一、电子版司法鉴定报告的合法性基础

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，司法鉴定报告作为证据的一种形式，其提交和保存方式并未明确限定为纸质版。在数字化时代，电子版证据（包括司法鉴定报告）的提交和保存已成为常态，只要能够确保其真实性、完整性和可读性，即符合法律要求。

2. 技术可行性：

   • 电子版司法鉴定报告可以通过加密、数字签名等技术手段确保其真实性和完整性，防止被篡改或伪造。同时，随着电子阅卷系统的普及，检察院和法院等司法机关已具备接收、存储和展示电子版证据的技术能力。

二、电子版司法鉴定报告在阅卷中的具体应用

1. 阅卷流程：

   • 在检察院阅卷时，律师或当事人可以通过电子阅卷系统查看和下载电子版司法鉴定报告。这一流程既方便又高效，有助于提升阅卷效率。

2. 证据效力：

   • 电子版司法鉴定报告在法庭上作为证据使用时，需经过质证程序。只要对方无异议或异议不成立，且电子版报告的真实性、完整性和关联性得到确认，其证据效力与纸质版报告相同。

三、可能存在的合法性争议及解决方式

1. 争议点：

   • 尽管电子版司法鉴定报告在技术上可行且法律上未明确禁止，但在某些情况下，可能因缺乏纸质版原件而引发关于证据真实性的争议。例如，如果电子版报告被篡改或伪造，且无法通过技术手段验证其真实性，则可能影响其证据效力。

2. 解决方式：

   • 加强技术保障：采用先进的加密技术和数字签名手段，确保电子版司法鉴定报告的真实性和完整性。
   • 完善阅卷制度：检察院应建立完善的电子阅卷制度，明确电子版证据的提交、存储、展示和质证程序，确保律师和当事人的阅卷权利得到充分保障。
   • 提供纸质版备份：在条件允许的情况下，检察院可以提供纸质版司法鉴定报告作为备份，以满足律师和当事人的不同需求。

四、实际操作建议

1. 提前沟通：

   • 在阅卷前，律师或当事人可以与检察院沟通，了解司法鉴定报告的提交形式（纸质版或电子版），并表达自己的需求和偏好。

2. 利用技术手段验证：

   • 如果收到的是电子版司法鉴定报告，律师或当事人可以利用技术手段（如数字签名验证工具）验证其真实性和完整性。

3. 及时提出异议：

   • 如果在阅卷过程中发现电子版司法鉴定报告存在真实性、完整性或可读性问题，律师或当事人应及时向检察院提出异议，并要求提供纸质版报告或采取其他补救措施。

总结来说，在检察院阅卷时，司法鉴定报告只有电子版而没有纸质版并不必然违法，但需确保电子版报告的真实性、完整性和可读性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。