结论前置：员工造成公司损失是否需由员工全部赔偿，不能一概而论，需根据具体情况、法律规定及合同约定综合判断。一般而言，员工仅在存在故意或重大过失时才需承担部分或全部责任；对于一般过失或无过失情况，损失通常由公司自行承担。
详细分析
一、员工存在故意或重大过失
合法性分析：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条规定，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。但用人单位承担侵权责任后，可以向有故意或者重大过失的工作人员追偿。这意味着，在员工存在故意或重大过失导致公司损失的情况下，公司要求员工承担赔偿责任具有法律依据。
- 同时，《工资支付暂行规定》第十六条也规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但赔偿需遵循一定的限制，如每月扣除的工资部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
实例说明：
- 如仓库管理员明知仓库禁止吸烟却仍违规操作，引发火灾并给公司造成巨大财产损失。在此情况下，公司在承担相关责任后，有权向该管理员追偿，要求其承担部分或全部损失。
赔偿比例与方式：
- 赔偿比例通常根据员工的过错程度、公司的管理责任及具体损失情况综合确定。员工可能需承担30%至70%左右的赔偿责任，但具体比例需在具体案件中判断，并受《工资支付暂行规定》中扣除限额的约束。
- 赔偿方式可以是一次性赔偿或分期赔偿，具体方式需根据劳动合同、公司规章制度及员工实际情况确定。
二、员工不存在故意或重大过失
合法性分析：
- 劳动关系具有从属性和风险性，企业作为经营主体应承担一定的经营风险。若员工在工作中不存在故意或重大过失，仅因工作失误或正常工作风险导致公司损失，要求员工承担全部或主要赔偿责任有失公平。
- 在此情况下，公司要求员工承担赔偿责任可能缺乏法律依据，且可能违反公平原则。
实例说明：
- 如销售人员按照公司销售策略和流程进行业务推广，但因市场环境变化等不可预见原因导致订单丢失。在这种情况下，让销售人员承担公司损失显然不合理。
公司管理责任：
- 若公司自身管理存在漏洞导致员工在执行职务过程中造成损失，员工可能不承担全部责任。公司应反思并改进管理体系，以降低类似风险的发生。
三、公司要求员工承担损失的限制与程序
赔偿额度限制：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的工资部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
事先约定与程序要求：
- 公司若要员工承担损失，最好在劳动合同或公司规章制度中明确规定赔偿办法和标准。该规章制度需符合法律规定的民主程序制定，并向员工公示，以确保其合法有效。
- 在发生损失后，公司应与员工进行协商，明确赔偿金额和方式。若协商不成，公司可依法申请劳动仲裁或提起诉讼。
总结与建议
在处理公司损失与员工责任的问题时，公司应全面考量员工的过错程度、行为性质、公司管理责任及损失大小等因素。对于员工存在故意或重大过失的情况，公司可依法要求员工承担部分或全部赔偿责任；但对于员工不存在故意或重大过失的情况，公司应自行承担损失或通过其他途径（如保险）进行风险转移。
同时，公司应依法依规制定明确的规章制度，明确赔偿办法和标准，并在发生损失后与员工进行充分协商。若协商不成，公司可依法申请劳动仲裁或提起诉讼以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。