在遗嘱中的签名笔迹样本由法院调令调取，但对方不承认的情况下，一般由否认笔迹真实性的一方承担举证责任。以下从不同角度为你详细分析：

举证责任分配原则

在民事诉讼中，举证责任的分配遵循“谁主张，谁举证”的基本原则。然而，在涉及笔迹鉴定等专门性问题时，这一原则会有所调整。当一方对遗嘱中的签名笔迹真实性提出质疑，即否认其真实性时，根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，该方需要承担举证责任，证明该笔迹并非遗嘱人本人所签。这是因为，从常理和逻辑上讲，否认一方需要提供足够的证据来支持其主张，否则将承担不利后果。

具体举证方式

1. 申请笔迹鉴定：

   • 否认笔迹真实性的一方可以向法院申请笔迹鉴定，由专业的鉴定机构对遗嘱中的签名笔迹进行鉴定。
   • 鉴定机构将依据科学的方法和程序，对笔迹进行比对和分析，最终出具鉴定意见。
   • 如果鉴定意见表明笔迹并非遗嘱人本人所签，那么否认一方的主张将得到支持。

2. 提供其他证据：

   • 除了申请笔迹鉴定外，否认一方还可以提供其他证据来支持其主张，如遗嘱人当时的身体状况、书写习惯、签名样本等。
   • 这些证据可以辅助证明遗嘱中的签名笔迹并非遗嘱人本人所签，或者存在其他影响遗嘱真实性的因素。

法院的角色与判断

• 法院在审理此类案件时，会综合考虑双方提供的证据和鉴定意见，进行客观、公正的判断。
• 如果否认一方无法提供足够的证据来支持其主张，或者提供的证据不足以推翻遗嘱中的签名笔迹的真实性，那么法院将认定遗嘱中的签名笔迹是真实的，并据此作出判决。

法律建议

• 及时申请鉴定：如果你作为否认笔迹真实性的一方，应当及时向法院申请笔迹鉴定，并提供足够的鉴定样本和相关信息，以确保鉴定的准确性和可靠性。
• 全面收集证据：除了申请鉴定外，你还应当全面收集其他可能影响遗嘱真实性的证据，如遗嘱人的身体状况、书写习惯、签名样本等，以辅助证明你的主张。
• 咨询专业律师：在处理此类复杂案件时，建议你咨询专业律师的意见和帮助。律师将能够为你提供专业的法律建议和指导，帮助你更好地维护自己的合法权益。

在处理遗嘱中的签名笔迹样本由法院调令调取但对方不承认的情况时，你需要明确自己的举证责任，并积极采取措施来支持自己的主张。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。