迟到扣200元是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合法性判断依据
公司规章制度：
- 如果公司规章制度中明确规定了迟到扣款的条款，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，同时该规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过）并公示或告知劳动者，那么迟到扣款可能是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
扣款金额合理性：
- 即使公司规章制度中有迟到扣款的条款，扣款金额也需合理。一般来说，扣款金额不应超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。如果扣款金额过高，可能被视为违法。
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
二、可能存在的违法情况
规章制度未公示或告知劳动者：
- 如果公司规章制度中规定了迟到扣款，但未公示或告知劳动者，那么该条款对劳动者不产生法律效力，迟到扣款可能被视为违法。
扣款金额超过法定标准：
- 如前所述，如果扣款金额超过劳动者当月工资的20%，或者扣除后的剩余工资低于当地最低工资标准，那么迟到扣款可能被视为违法。
未与劳动者协商一致：
- 如果公司未经与劳动者协商一致，单方面决定迟到扣款，且该决定违反了法律法规的强制性规定或公司规章制度，那么迟到扣款可能被视为违法。
三、建议与措施
劳动者角度：
- 如果认为迟到扣款不合法，可以与公司协商解决，要求公司退还违法扣款。
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
公司角度：
- 在制定规章制度时，应确保条款合法合规，并经过民主程序制定和公示或告知劳动者。
- 在执行迟到扣款时，应确保扣款金额合理，不超过法定标准，并保留相关证据以备查证。
总结来说，迟到扣200元是否合法需根据具体情况判断。如果公司规章制度中有明确规定且合法合规，同时扣款金额合理，那么迟到扣款可能是合法的。否则，可能被视为违法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。