针对您提出的“国有公司违法分包转包政府采购项目怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
在政府采购项目中，国有公司若存在违法分包或转包的行为，将面临一系列严重的法律后果。这些后果不仅涉及行政责任，还可能包括民事责任和刑事责任，具体处理措施如下：
一、行政责任
责令改正及没收违法所得：
- 国有公司一旦被发现违法分包或转包，建设行政主管部门将立即责令其停止违法行为，并恢复工程至合法状态。同时，公司因违法分包或转包所获得的全部收入将被没收。
罚款与赔偿：
- 国有公司需承担工程合同价款0.5%至1%的罚款。若因违法分包或转包导致工程质量不达标，造成损失，公司还需承担相应的赔偿责任。
停业整顿与降低资质等级：
- 对于情节较为严重的违法分包或转包行为，国有公司将面临停业整顿的处罚，期间不得承接新的工程。同时，公司的资质等级将被降低，限制其未来可承接工程的规模和范围。
吊销资质证书与市场准入限制：
- 在极端情况下，如违法分包或转包行为导致重大质量安全事故或其他严重后果，国有公司的资质证书将被吊销，彻底丧失在建筑市场承接工程的资格。此外，公司还可能被列入黑名单，禁止在一定期限内参与任何工程建设活动。
通报批评与信用惩戒：
- 违法分包或转包行为将被公开通报批评，并纳入建筑市场信用管理体系。这将严重影响公司的信誉和市场竞争力，如在招投标中受到限制。
二、民事责任
工程质量连带责任：
- 违法分包或转包合同通常无效。若因此导致工程质量问题，国有公司与接受分包的单位需共同对建设单位承担连带赔偿责任，包括修复费用及其他相关损失。
违约责任：
- 尽管违法分包或转包合同无效，但若违反了总承包合同约定，建设单位仍可要求国有公司承担违约责任，赔偿因其行为造成的损失，如工期延误等。
三、刑事责任
重大安全事故罪：
- 若违法分包或转包行为导致重大安全事故，造成人员伤亡或重大财产损失，相关责任人员可能构成重大安全事故罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将面临五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；后果特别严重者，将受五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
串通投标罪：
- 在违法分包或转包过程中，若存在串通投标行为，损害招标人或其他投标人利益，且情节严重的，可能构成串通投标罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。
总结与建议：
国有公司在参与政府采购项目时，必须严格遵守相关法律法规，确保施工活动的合法性和规范性。违法分包或转包不仅会导致严重的法律后果，还会损害公司的信誉和市场竞争力。因此，我建议您公司加强内部管理，建立健全的合规体系，确保所有施工活动都符合法律法规的要求。同时，若发现任何违法分包或转包的迹象，应立即采取措施予以纠正，并主动向相关部门报告，以避免可能的法律风险和经济损失。