结论：员工瞒着公司以公司名义借款，公司可能面临承担还款责任的风险，但可通过积极应对措施来降低损失并追究员工责任。以下从不同角度详细分析：
一、公司可能面临的法律责任
表见代理风险：
- 根据《民法典》的相关规定，如果员工的行为构成表见代理，即相对人有理由相信员工有权代表公司借款，且公司不能证明相对人明知员工无权代理，那么公司可能需要承担还款责任。
- 例子：员工持有公司公章、合同章或财务章，并以公司名义与出借人签订借款合同，出借人基于对员工身份和印章的信任而出借资金，此时公司可能因表见代理而承担还款责任。
内部管理责任：
- 如果公司内部管理存在漏洞，如印章管理不善、授权不明确等，导致员工能够轻易以公司名义借款，公司可能因内部管理不善而承担一定的法律责任。
二、公司的应对措施
立即报警并调查：
- 公司一旦发现员工瞒着公司以公司名义借款，应立即向公安机关报案，并配合公安机关进行调查，以查明事实真相。
- 同时，公司应内部调查借款的具体情况，包括借款金额、借款用途、借款流向等，以便后续处理。
收集证据并主张权利：
- 公司应收集相关证据，如借款合同、转账记录、员工身份证明、公司印章使用记录等，以证明员工的行为未经公司授权或构成欺诈。
- 如果公司能够证明员工的行为未经授权或构成欺诈，且出借人明知或应知员工无权代理，公司可以向法院主张不承担还款责任，并要求员工承担赔偿责任。
加强内部管理：
- 公司应加强内部管理，完善印章管理制度、授权审批制度等，防止类似事件再次发生。
- 同时，公司应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识，避免员工因法律意识淡薄而触犯法律。
三、追究员工责任
刑事责任：
- 如果员工的行为构成犯罪，如诈骗罪、职务侵占罪等，公司可以向公安机关报案，要求追究员工的刑事责任。
- 法律依据：根据《刑法》的相关规定，诈骗公私财物数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。职务侵占罪也有相应的刑罚规定。
民事责任：
- 除了刑事责任外，公司还可以向法院提起民事诉讼，要求员工承担赔偿责任，包括赔偿公司因员工行为而遭受的损失、支付违约金等。
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
四、建议与提醒
- 及时咨询专业律师：在处理此类事件时，公司应及时咨询专业律师，以便更好地了解法律程序和自身权益，制定合适的应对策略。
- 保持冷静与理性：公司在处理此类事件时，应保持冷静与理性，避免情绪化决策或采取过激行为，以免加重损失或引发其他法律风险。
作为封建国律师，我专注于刑事辩护和公司事务领域，如果你在这方面有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。