结论：借款人儿子在其父亲公司贷款后所购房产是否能被查封拍卖，需视具体情况而定，主要取决于该房产是否被认定为借款人（即父亲）的财产或是否与贷款存在直接关联。以下从不同角度进行分析：
房产登记情况：
- 若房产登记在借款人儿子名下：通常情况下，房产作为不动产，其所有权以登记为准。因此，若房产明确登记在借款人儿子名下，且该儿子为完全民事行为能力人，那么该房产应被视为其个人财产，而非借款人（父亲）的财产。在此情况下，除非有证据表明该房产的购买资金来源于借款人（父亲）的非法所得或用于担保贷款，否则一般不能直接查封拍卖该房产以偿还借款人（父亲）的债务。
- 若房产虽登记在借款人儿子名下，但实际为借款人（父亲）出资购买：这种情况下，房产的权属可能存在争议。如果借款人（父亲）能够证明其出资购买房产，且该出资并非赠与儿子，而是出于某种特定目的（如逃避债务），那么该房产可能被视为借款人（父亲）的财产或至少与贷款存在关联，从而有可能被查封拍卖。但这需要具体的证据支持，并需经过法律程序的认定。
贷款用途与房产关联：
- 若贷款用于购买该房产：如果借款人（父亲）以公司名义贷款，且该贷款明确用于购买其儿子名下的房产，那么该房产与贷款之间存在直接关联。在此情况下，如果借款人（父亲）未能按时偿还贷款，银行或贷款机构有权根据贷款合同和相关法律规定，对作为抵押物或关联财产的房产进行查封拍卖。
- 若贷款未用于购买该房产：如果贷款并未用于购买该房产，而是用于其他用途，那么该房产与贷款之间不存在直接关联。在此情况下，除非有特殊情况（如借款人（父亲）将房产作为其他债务的担保物），否则一般不能直接查封拍卖该房产。
法律程序与证据要求：
- 查封拍卖需经过法律程序：无论何种情况，对房产进行查封拍卖都需要经过严格的法律程序，包括起诉、判决、执行等阶段。银行或贷款机构不能直接自行查封拍卖房产，而需要向法院申请，并由法院根据相关法律规定和证据进行裁决。
- 证据要求严格：在查封拍卖过程中，银行或贷款机构需要提供充分的证据证明房产与贷款之间的关联或借款人（父亲）的出资情况等。如果证据不足或存在争议，法院可能不会支持查封拍卖的申请。
建议：
- 如果您是借款人（父亲）或其儿子，且面临此类问题，建议首先咨询专业律师，了解具体的法律程序和证据要求。
- 收集并保留所有与房产购买、贷款用途等相关的证据材料，以便在需要时提供给法院或相关机构。
- 积极配合法律程序，尊重法院的裁决结果，并依法维护自己的合法权益。
如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。