结论：进厂不做满三个月离职不通过是否合法，需根据具体情况判断，主要取决于劳动合同或公司规章制度中的相关约定是否合法有效。

分析如下：

1. 劳动合同或公司规章制度中的约定：

   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工必须做满一定期限（如三个月）才能离职，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么员工在未做满该期限时提出离职，公司有权不批准，但员工仍可依法提前通知解除劳动合同（如试用期提前三日，非试用期提前三十日）。不过，若公司以此为由拒绝办理离职手续或克扣工资等，则可能构成违法。
   • 如果劳动合同或公司规章制度中的相关规定违反了法律法规的强制性规定（如限制员工离职自由、设定不合理的违约金等），则这些规定是无效的，员工有权依法离职，公司不得阻挠。

2. 法律法规的强制性规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，员工有权依法解除劳动合同。在试用期内，员工提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同；非试用期内，员工提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。这些规定是强制性的，公司不得通过劳动合同或规章制度来剥夺或限制员工的这一权利。
   • 如果公司以员工未做满一定期限为由拒绝办理离职手续、克扣工资或要求支付违约金等，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

3. 实际操作中的建议：

   • 对于员工而言，在入职前应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解其中的相关规定。如果发现有不合理的条款或违反法律法规的规定，应及时与公司沟通或寻求法律帮助。
   • 在离职时，员工应依法提前通知公司，并按照公司规定办理离职手续。如果公司拒绝办理或克扣工资等，员工可以保留相关证据（如劳动合同、规章制度、通知记录、工资条等），并向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

举例说明：

• 假设某公司的规章制度中规定：“新员工必须做满三个月才能离职，否则需支付违约金。”这一规定可能违反了《中华人民共和国劳动合同法》中关于员工离职自由的规定，因此是无效的。员工在未做满三个月时提出离职，公司不得要求支付违约金或拒绝办理离职手续。
• 另一方面，如果劳动合同中约定：“员工在试用期内离职需提前三日通知公司。”这一约定是合法的，员工应遵守。如果员工未提前通知而擅自离职，公司可能有权要求员工承担相应的责任（如赔偿因擅自离职给公司造成的损失等）。但这一责任并不包括阻止员工离职或克扣工资等。

总结与建议：

• 进厂不做满三个月离职不通过是否合法，需根据劳动合同或公司规章制度中的相关约定以及法律法规的强制性规定来判断。
• 员工在入职前和离职时应仔细了解相关规定，并依法维护自己的合法权益。
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