处理出轨短信时，合法的方式需严格遵循证据收集规则和隐私权保护原则，具体分为以下两种情况处理：

1. 若需作为离婚诉讼中的证据使用

根据《民法典》第1079条，出轨短信可作为证明“夫妻感情破裂”或“重大过错”的间接证据，但需满足以下合法性要求：

• 证据形式合法：短信需原始载体（如手机），不得仅提供截图或打印件。若手机丢失，可申请法院调取运营商记录，但需提供对方手机号、发送时间等关键信息。
• 内容关联性：短信需明确体现出轨事实（如“今晚在你家过夜”），且发送方需为配偶或第三者本人。若涉及暧昧称呼但无实质内容，可能被认定为“感情不和”而非出轨。
• 隐私权边界：不得通过非法手段获取短信（如黑客入侵、偷拍手机），否则可能因侵犯隐私权被法院排除证据，甚至面临行政处罚（《治安管理处罚法》第42条）。

建议操作：

• 发现短信后，立即对手机进行公证保全（可联系当地公证处），固定证据原始性。
  
• 若短信涉及第三者，可尝试通过合法途径（如律师调查令）调取其身份信息，但需严格遵守法院程序。

2. 若仅需私下处理或警示对方

若不涉及诉讼，处理出轨短信时需注意：

• 不得公开传播：将短信内容发布至社交媒体、群聊或向他人扩散，可能侵犯配偶及第三者的隐私权、名誉权（《民法典》第1032-1033条），需承担停止侵害、赔礼道歉等民事责任。
• 谨慎沟通：可与配偶私下沟通，出示短信作为谈判依据，但需避免言语威胁或人身攻击，否则可能涉嫌家庭暴力（《反家庭暴力法》第2条）。
• 保留证据：若担心配偶转移财产或销毁证据，可将短信备份至云端或U盘，但需确保备份过程合法（如不通过非法软件破解手机）。

特殊提醒：
若短信内容涉及威胁、敲诈勒索（如“给我钱否则公开”），需立即报警，此类行为可能构成刑事犯罪（《刑法》第274条）。

总结：出轨短信的合法处理核心是“证据合法性”与“隐私权平衡”。若需进一步分析短信内容是否符合证据标准，或制定诉讼策略，可直接向我提供具体信息，我会结合案例为您详细解答。