结论：在两人合伙开厂的情况下，法定代表人的确定应首先遵循公司章程或合伙协议中的约定，通过协商或投票等方式选举产生，并确保其具备相应的管理能力和商业信誉。选定后，需按照相关规定进行登记，以确保其任职具有法律效力。
一、法律依据与确定方式
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》第十三条的规定，公司法定代表人由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。这意味着，在两人合伙开厂的情况下，法定代表人必须从公司的董事长、执行董事或经理中选出，并需进行工商登记。
确定方式：
- 协商确定：两个合伙人可以基于各自的优势、出资比例、对公司运营的规划等因素进行充分沟通协商，共同决定由谁担任法定代表人。这种方式灵活且能够体现双方的意愿。
- 章程/协议规定：公司章程或合伙协议中应明确规定法定代表人的产生办法，如由出资较多的股东担任、通过投票表决等。若章程或协议未明确规定，或规定不明确，则可由全体股东或合伙人协商决定或通过投票等方式产生。这种方式能够确保法定代表人的产生有明确的依据，减少后续纠纷。
二、考虑因素与选举标准
在选择法定代表人时，应考虑以下因素：
- 管理能力：确保选定的法定代表人具备足够的公司运营和管理经验，能够胜任公司的日常管理工作。
- 商业信誉：良好的商业信誉是法定代表人能够代表公司并维护公司利益的重要基础。一个信誉良好的法定代表人能够增强公司的市场竞争力。
- 出资比例与话语权：虽然出资比例可能影响话语权，但最终应以双方协商一致为准。避免因出资比例问题而产生纠纷，影响公司的稳定运营。
三、登记流程与法律效力
- 确定法定代表人后，需准备相关材料（如身份证明、任职文件等）向公司登记机关申请设立登记。这是确保法定代表人任职具有法律效力的必要步骤。
- 经登记机关核准登记后，法定代表人的任职才具有法律效力，开始正式履行其职责。未经登记或登记不实的法定代表人，其任职可能无效，无法代表公司行使职权。
四、建议与风险防范
- 书面协议：为避免日后产生纠纷，建议在合伙协议或公司章程中详细规定法人代表的选举、更换、职责等相关事宜。这样能够确保双方的权利和义务得到明确界定，减少后续纠纷的可能性。
- 充分考虑权责利关系：合伙人在确定法定代表人时，应充分考虑各自的权责利关系，确保公司的稳定运营和双方利益的最大化。避免因权责不清而产生纠纷，影响公司的长期发展。
- 定期评估与调整：根据公司的发展情况和法定代表人的表现，定期进行评估和调整。确保公司始终由最适合的人担任法定代表人，以适应市场变化和公司发展的需要。
综上所述，两人合伙开厂时确定法定代表人是一个涉及多个法律知识点的复杂问题。通过遵循法律依据、考虑多种因素、严格按照登记流程操作，并采取相应的风险防范措施，可以确保法定代表人的确定既合法又有效，为公司的稳定发展奠定坚实基础。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。