在行政案件中，若发现询问程序不合法，可以采取以下措施进行处理，我将分情况详细说明：

1. 提出异议并要求纠正
   在询问过程中，若当事人或其代理人发现询问程序存在违法情形（如未出示证件、未告知权利义务、诱导性询问、超范围询问等），应当场提出异议，要求询问人员立即纠正。若询问人员拒绝纠正，可明确记录违法情形（包括时间、地点、询问人员姓名、违法具体表现），并要求在询问笔录中注明“当事人对询问程序提出异议”。

2. 申请排除非法证据
   若询问程序违法导致证据收集不合法（如未全程录音录像、未两名执法人员在场、未保障陈述申辩权等），可在后续行政程序中（如听证、复议或诉讼阶段）提出“非法证据排除申请”。根据《行政诉讼法》及相关司法解释，违反法定程序收集的证据可能被认定为“不能作为认定案件事实的根据”，从而削弱行政行为的合法性基础。

3. 通过复议或诉讼救济

   • 行政复议阶段：若行政行为已作出（如行政处罚决定），可在申请复议时主张“程序违法”，要求复议机关撤销或变更原行政行为。需重点说明询问程序违法如何影响实体权利（如未保障陈述权导致事实认定错误）。
     
   • 行政诉讼阶段：若复议未获支持或直接提起诉讼，可在起诉状中明确将“询问程序违法”列为诉讼理由，并提交相关证据（如询问笔录、现场录音录像、证人证言等）。法院将根据《行政诉讼法》第七十条审查程序合法性，若程序违法且可能影响公正审判，可能判决撤销或部分撤销行政行为。

4. 投诉或举报执法人员
   若询问程序违法涉及执法人员故意违规（如伪造笔录、威胁利诱等），可向其所属行政机关的纪检监察部门或上级机关投诉，或通过“12345”政务服务热线举报。需提供具体线索（如时间、地点、人员姓名、违法事实），以便启动内部调查程序。

温馨提示：

• 保留证据是关键：务必保存询问笔录、现场照片、录音录像等材料，这些是证明程序违法的重要依据。
  
• 及时行动很重要：行政复议需在知道行政行为之日起60日内提出，行政诉讼需在6个月内起诉，逾期可能丧失救济权利。
  

若您遇到具体案件中的询问程序问题，欢迎进一步向我描述细节，我将结合案情为您分析应对策略。