结论：针对您儿子被同龄人殴打并要求赔偿5000元但对方不同意的情况，您可以通过协商、调解、诉讼等途径来维护您儿子的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律背景
人格权保护：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人享有生命权、身体权、健康权等人格权。任何组织或者个人不得侵害他人的人格权。在此案例中，您儿子被殴打，其身体权和健康权受到了侵害。
侵权责任：根据《民法典》侵权责任编的规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在此案例中，殴打您儿子的行为人应当承担相应的侵权责任，包括赔偿损失等。
二、赔偿问题
赔偿范围：赔偿范围通常包括医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入（对于未成年人，主要是监护人因照顾而产生的误工费等）。如果造成残疾，还应当赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应当赔偿丧葬费和死亡赔偿金。在此案例中，您要求的5000元赔偿应当基于实际产生的费用和合理的预期损失。
赔偿协商：您可以先与对方及其监护人进行协商，尝试达成赔偿协议。在协商过程中，您可以提供相关的医疗费用单据、护理费用证明等证据，以支持您的赔偿要求。
三、解决途径
调解：如果协商不成，您可以考虑向当地的调解委员会或者人民调解组织申请调解。调解委员会或者人民调解组织会组织双方进行调解，并尝试达成赔偿协议。
诉讼：
四、特别提示
证据收集：在整个过程中，证据的收集至关重要。您应当尽可能收集并保存所有与案件相关的证据，如医疗记录、费用单据、证人证言等。这些证据将在协商、调解或诉讼过程中发挥关键作用。
法律程序：了解并遵循法律程序是维护自身权益的重要保障。如果您对法律程序不熟悉，建议咨询专业律师或者寻求法律援助机构的帮助。
未成年人保护：由于您儿子是未成年人，他在法律上享有特殊的保护。在处理此类案件时，应当充分考虑未成年人的身心特点和利益保护需求。
如果您在此过程中遇到任何问题或者需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。