您好，针对您提出的“燃气主管部门因为企业不整合不给发燃气经营许可证是否合法”的问题，我将结合相关法律法规和实际情况为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，国家对燃气经营实行的是许可证制度，这是根据《城镇燃气管理条例》第十五条明确规定的。该条例详细列出了从事燃气经营活动的企业应当具备的条件，包括但不限于符合燃气发展规划要求、有符合国家标准的燃气气源和燃气设施、企业的主要负责人和安全生产管理人员等需经专业培训并考核合格，以及满足法律、法规规定的其他条件。只有符合这些条件的企业，才能由县级以上地方人民政府燃气管理部门核发燃气经营许可证。

接下来，我们分析您提到的“企业不整合”这一情况。企业整合通常指的是企业为了优化资源配置、提高市场竞争力等原因而进行的合并、重组等行为。然而，在燃气经营许可证的核发条件中，并未直接提及“企业必须整合”这一要求。因此，从法律条文的角度来看，企业是否整合并不是决定其能否获得燃气经营许可证的直接因素。

但是，我们需要考虑到的是，如果企业不整合导致其无法满足《城镇燃气管理条例》中规定的其他条件，比如无法符合燃气发展规划要求、无法提供符合国家标准的燃气气源和设施等，那么燃气主管部门是有权拒绝核发燃气经营许可证的。因为这些条件是确保燃气经营活动安全、有序进行的基础，也是保护公众利益和社会公共安全的重要措施。

此外，如果企业未经许可擅自从事燃气经营活动，根据《城镇燃气管理条例》第四十五条第一款的规定，燃气管理部门将责令其停止违法行为，并处以5万元以上50万元以下的罚款；有违法所得的，还将没收违法所得；构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。

综上所述，燃气主管部门因为企业不整合而直接拒绝核发燃气经营许可证的行为，在法律上并没有明确的依据。但如果企业不整合导致其无法满足燃气经营许可证的核发条件，那么燃气主管部门是有权拒绝核发的。因此，建议您在申请燃气经营许可证前，先仔细了解并满足相关法律法规规定的条件，以确保申请的顺利进行。