恶意离职的员工，其工资是否发放需分情况讨论：

1. 恶意离职不影响工资发放的基本原则
   根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。即使员工存在恶意离职行为（如未提前通知、擅自离职等），只要其实际提供了劳动，用人单位就应当支付相应工资。恶意离职属于违反劳动合同或公司规章制度的行为，但工资支付与离职行为性质是两个独立的法律关系，用人单位不能以“恶意离职”为由直接拒付工资。

2. 用人单位可主张赔偿，但需通过合法途径
   若员工恶意离职给用人单位造成损失（如未交接工作导致业务停滞、客户流失等），用人单位可依据《中华人民共和国劳动合同法》第九十条，要求员工承担赔偿责任。但需注意：

   • 赔偿需举证：用人单位需证明损失与员工恶意离职的直接因果关系（如财务记录、客户投诉等）；
     
   • 赔偿方式：用人单位不能直接从工资中扣除赔偿款，而应通过劳动仲裁或诉讼主张权利；
     
   • 扣除工资的限制：即使员工同意扣除，每月扣除部分也不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

3. 实务中的操作建议

   • 对用人单位：
     
     • 在劳动合同或规章制度中明确“恶意离职”的定义及赔偿标准（需经民主程序公示）；
       
     • 员工离职时，及时固定证据（如工作交接记录、损失证明）；
       
     • 通过法律途径主张赔偿，而非拒付工资。
       
   • 对员工：
     
     • 即使离职存在争议，也应保留出勤记录、工作成果等证据，以证明应得工资；
       
     • 若用人单位拒付工资，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：恶意离职不影响员工获得已提供劳动的工资，但用人单位可依法主张赔偿。双方均需通过合法途径解决争议，避免因单方行为扩大损失。如有具体案情，可进一步向我咨询。