在农用地上违法建房，将面临行政处罚、民事赔偿以及可能的刑事处罚，具体如下：
行政处罚：
- 责令退还土地：根据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地。这意味着，违法建房者必须将所占用的农用地恢复原状，退还给原土地使用者或集体。
- 限期拆除或没收：对于在非法占用的土地上新建的房屋和其他设施，如果符合土地利用总体规划，可能会被没收；如果不符合土地利用总体规划，则会被责令限期拆除，恢复土地原状。
- 罚款：除了上述措施外，违法建房者还可能面临罚款。罚款的数额通常根据非法占用土地的面积和土地的类型（如基本农田、一般耕地等）来确定，罚款标准可能因地区而异，但一般会按照非法占用土地每平方米一定金额来计算。
民事赔偿：
- 如果违法建房行为给原土地使用者或集体造成了经济损失，违法建房者还需要承担民事赔偿责任。这包括赔偿因土地被占用而导致的农作物损失、土地租金损失等。
刑事处罚：
- 非法占用农用地罪：根据《中华人民共和国刑法》第三百四十二条，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。这意味着，如果违法建房行为严重到一定程度，违法者可能会面临刑事处罚。
建议与提醒：
- 在进行任何建设活动之前，务必确保已经获得了合法的土地使用许可和建设许可。
- 如果对土地使用或建设许可的流程有疑问，建议咨询当地自然资源主管部门或相关法律专业人士。
- 如果已经发生了违法建房行为，建议尽快与相关部门沟通，了解具体的处罚措施，并积极配合整改，以减少损失和法律风险。
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