针对您提出的宅基地地界协议书确认权的问题，首先明确结论：时隔12年后，若您希望确认宅基地地界的协议书效力或进行相关权属确认，一般应向当地的自然资源部门（原国土资源部门）或相关政府部门提出申请。以下是从不同角度进行的详细分析：

1. 协议书的基本性质与效力：

   • 宅基地地界协议书，作为双方就宅基地使用范围、界限等达成的共识，通常具有一定的法律效力。但协议书的效力不仅取决于双方的签名，还受到相关法律法规的约束和保护。
   • 时隔12年，协议书本身并不会因为时间的流逝而自动失效，但其效力可能受到后续法律法规变化、宅基地政策调整等因素的影响。

2. 确认权属的申请部门：

   • 自然资源部门：根据现行法律法规，宅基地的管理和权属确认通常由自然资源部门负责。您可以向当地的自然资源部门提交申请，要求确认宅基地地界的协议书效力或进行权属确认。
   • 相关政府部门：在某些地区，可能还存在其他与宅基地管理相关的政府部门，如农业农村部门等。您也可以咨询这些部门，了解具体的申请流程和所需材料。

3. 申请流程与所需材料：

   • 申请流程：一般来说，您需要先向相关部门提交书面申请，说明申请事项、理由和依据。然后，相关部门会进行审查，可能要求您补充材料或进行现场勘查。最后，相关部门会出具确认意见或决定。
   • 所需材料：通常包括宅基地地界协议书原件、双方身份证明、宅基地使用权证（如有）、相关权属证明文件等。具体所需材料可能因地区而异，建议您提前咨询相关部门。

4. 可能遇到的法律问题与建议：

   • 协议书内容争议：如果双方对协议书内容存在争议，可能需要通过法律途径解决。此时，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
   • 政策变化影响：如果宅基地政策发生变化，可能影响协议书的效力或权属确认结果。因此，在申请前，建议您了解最新的宅基地政策，以便更好地应对可能的问题。

5. 后续行动建议：

   • 在提交申请前，建议您先与对方进行沟通，尽量通过协商解决争议。如果协商无果，再考虑向相关部门申请确认权属。
   • 在申请过程中，保持与相关部门的沟通联系，及时了解申请进展和结果。如果申请被驳回或存在异议，您可以根据相关法律法规和程序进行申诉或复议。

最后，需要强调的是，宅基地权属确认是一个复杂且敏感的问题，涉及多方利益和法律法规的约束。因此，在处理此类问题时，建议您务必谨慎行事，并咨询专业律师的意见。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。