结论：建设单位违规指挥时，施工单位是否承担责任需分情况讨论，主要取决于施工单位是否尽到了合理的审查、拒绝及报告义务。
施工单位无责任的情况：
- 合理审查与拒绝：若施工单位在接到建设单位的违规指挥后，进行了合理的审查，并明确拒绝了违规指挥的要求，同时采取了必要的措施防止违规行为的发生或扩大，那么施工单位通常不承担责任。这是因为施工单位已经尽到了其应尽的注意义务和拒绝义务。
- 及时报告：施工单位在拒绝违规指挥的同时，如果还及时向相关部门（如建设行政主管部门、安全监督机构等）报告了建设单位的违规行为，那么这也将作为施工单位免责的重要依据。
施工单位可能承担责任的情况：
- 未审查或未拒绝：如果施工单位在接到建设单位的违规指挥后，未进行合理的审查，或者虽然审查了但未拒绝违规指挥的要求，而是按照违规指挥进行了施工，那么施工单位可能需要承担相应的责任。这是因为施工单位未尽到其应尽的注意义务和拒绝义务，对违规行为的发生或扩大存在过错。
- 未报告或报告不及时：即使施工单位拒绝了违规指挥，但如果未及时向相关部门报告建设单位的违规行为，或者报告不及时导致违规行为未能得到及时制止，那么施工单位也可能因未尽到报告义务而承担一定的责任。不过，这种责任通常较轻，且需根据具体情况进行判断。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国安全生产法》等相关法律法规的规定，建设单位和施工单位都应当遵守法律法规，确保工程建设的安全和质量。建设单位不得违规指挥，施工单位也不得盲目执行违规指挥。
- 对于施工单位而言，面对建设单位的违规指挥，应坚持原则，拒绝执行，并及时向相关部门报告。同时，施工单位还应加强内部管理，提高员工的法律意识和安全意识，确保工程建设的安全和质量。
- 如果施工单位因建设单位的违规指挥而遭受了损失或面临了法律责任，施工单位可以依法向建设单位追偿或要求建设单位承担相应的法律责任。
可能法律后果：
- 如果施工单位未尽到上述义务，可能会面临行政处罚（如罚款、停业整顿等）、民事赔偿（如因违规行为导致的人身伤害或财产损失赔偿）以及刑事责任（如因违规行为导致重大安全事故，构成犯罪的，依法追究刑事责任）等法律后果。
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