公司修订操作程序后，员工不遵守是否构成严重违纪，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下从几个关键角度进行分析：

1. 操作程序的合法性与合理性：

   • 首先，要确认公司修订的操作程序是否合法、合理，并且是否已经通过合法程序（如职工代表大会或全体职工讨论、与工会或职工代表平等协商等）进行公示或告知员工。如果操作程序本身存在违法或不合理之处，员工有权拒绝遵守，此时不构成严重违纪。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。并且，用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。

2. 员工不遵守的具体情形：

   • 如果操作程序合法、合理，并且员工已经明确知晓，但员工仍然故意不遵守，且这种不遵守行为对公司的正常运营、生产安全等造成了严重影响，那么可以视为严重违纪。
   • 如果员工不遵守操作程序是由于疏忽、无知或误解等原因造成的，且未造成严重后果，那么一般不应视为严重违纪。

3. 公司规章制度中的规定：

   • 公司规章制度中可能明确规定了哪些行为构成严重违纪。如果员工不遵守操作程序的行为符合规章制度中规定的严重违纪情形，那么公司可以依据规章制度进行处理。
   • 注意：公司规章制度必须合法、合理，并且已经通过合法程序进行公示或告知员工，才能作为处理员工的依据。

4. 处理建议：

   • 对于员工不遵守操作程序的行为，公司应首先进行调查核实，了解员工不遵守的具体原因和情节轻重。
   • 如果员工的行为确实构成严重违纪，公司可以依据规章制度进行处理，但处理过程必须合法、公正，确保员工的合法权益不受侵害。
   • 如果员工的行为不构成严重违纪，公司应以教育、警告为主，引导员工遵守操作程序，确保公司的正常运营和生产安全。

总结来说，公司修订操作程序后，员工不遵守是否构成严重违纪，需要综合考虑操作程序的合法性与合理性、员工不遵守的具体情形、公司规章制度中的规定以及处理过程的合法性与公正性等因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。