结论概述：员工主动提离职但不签离职协议，用人单位可采取多种措施来应对，包括与员工沟通协商、按照公司规章制度处理、保留相关证据以及必要时通过法律途径解决。以下是对这些措施的详细解释和建议。

1. 与员工沟通协商

• 沟通目的：首先，用人单位应尝试与员工进行友好沟通，了解其不签离职协议的具体原因。可能是员工对离职协议中的某些条款存在异议，或者是对离职流程、待遇等方面有疑问。
• 沟通方式：可以通过面对面会议、电话沟通或书面函件等方式进行。在沟通过程中，保持耐心和尊重，尽量以协商的方式解决问题。
• 协商内容：针对员工提出的异议或疑问，用人单位可以解释相关条款的法律依据和合理性，或者根据实际情况对离职协议进行适当修改，以达成双方都能接受的协议。

2. 按照公司规章制度处理

• 规章制度依据：如果公司有明确的规章制度关于员工离职和离职协议的签订，用人单位可以依据这些规章制度来处理。
• 处理流程：按照规章制度规定的流程，向员工发出书面通知，要求其在规定时间内签订离职协议。如果员工仍拒绝签订，用人单位可以依据规章制度采取相应的措施，如扣除部分工资、暂停办理离职手续等（但需注意这些措施需合法合规，不得侵犯员工合法权益）。

3. 保留相关证据

• 证据种类：用人单位应保留与员工离职相关的所有证据，包括员工提出的离职申请、与员工的沟通记录（如邮件、短信、微信聊天记录等）、公司规章制度等。
• 证据作用：这些证据在后续可能出现的法律纠纷中至关重要，可以证明用人单位已经履行了相应的义务，而员工拒绝签订离职协议是违反公司规定或合同约定的行为。

4. 必要时通过法律途径解决

• 法律途径选择：如果经过沟通协商和按照公司规章制度处理后，员工仍然拒绝签订离职协议，用人单位可以考虑通过法律途径解决。这包括向劳动仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
• 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，员工离职应当签订离职协议，明确双方的权利和义务。如果员工拒绝签订，用人单位有权要求其承担相应的法律责任。
• 法律后果：如果法院或仲裁委员会认定员工确实存在拒绝签订离职协议的行为，且该行为违反了法律法规或合同约定，那么员工可能需要承担违约责任，包括赔偿用人单位因此遭受的损失等。

额外建议：

• 预防措施：为了避免类似情况的发生，用人单位可以在员工入职时就明确告知其离职时需要签订离职协议，并在劳动合同中对此进行约定。同时，公司也可以定期对员工进行劳动法律法规的培训，提高员工的法律意识。
• 灵活处理：在处理此类问题时，用人单位也应保持一定的灵活性。如果员工确实存在特殊情况或合理诉求，用人单位可以在合法合规的前提下进行适当妥协和调整，以维护良好的劳动关系。

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