公司被冒用开票属于严重的违法行为，需立即采取以下措施处理：

1. 立即向税务机关报案
   第一时间联系主管税务机关（如税务局稽查局），说明公司被冒用开票的具体情况，包括：

   • 冒用开票的时间、金额、发票号码等关键信息；
     
   • 冒用方可能使用的公司名义、银行账户等线索；
     
   • 提供公司公章、财务章、发票专用章等印鉴的管理记录，证明公司未参与开票行为。
     税务机关会启动调查程序，若确认属于冒用，可撤销相关发票并避免公司承担税款责任。

2. 向公安机关经侦部门报案
   若冒用行为涉嫌犯罪（如虚开发票罪、诈骗罪等），需向公安机关经济犯罪侦查部门报案，提交：

   • 被冒用开票的发票复印件、税务机关出具的调查证明；
     
   • 公司营业执照、法定代表人身份证明等材料；
     
   • 任何可证明公司未参与开票的证据（如内部审批流程记录、员工证言等）。
     公安机关立案后，可追查冒用方责任，避免公司被牵连。

3. 内部自查与整改

   • 排查风险点：检查公司印章、税控设备、开票系统等是否被非法获取或使用；
     
   • 加强管理：完善印章保管制度、开票审批流程，定期核对发票使用记录；
     
   • 通知合作方：若冒用发票已流转至客户或供应商，需及时说明情况，避免对方误用导致税务风险。

4. 应对税务稽查与法律责任

   • 若税务机关已对公司发起稽查，需积极配合调查，提供完整证据链证明被冒用事实；
     
   • 若公司因被冒用开票被要求补税或罚款，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，主张“无过错责任”；
     
   • 保留所有报案、沟通记录，作为后续维权依据。

风险提示：

• 若公司未及时报案或证据不足，可能被税务机关认定为“默许冒用”，需承担补税、滞纳金甚至罚款责任；
  
• 冒用行为可能涉及刑事犯罪，公司若未主动报案，可能被认定为“共犯”或“包庇”。

建议：

• 立即启动报案程序，同步联系我协助整理证据、撰写报案材料；
  
• 若税务机关或公安机关要求公司配合调查，可由我陪同处理，确保程序合法合规。
  

如有进一步细节（如冒用方式、发票流向等），可随时补充说明，我会为您制定更具体的应对方案。