用人单位收到法院对员工的协助执行通知书时，应当依法配合执行，具体处理方式需根据通知书内容及执行事项的性质来决定。以下是详细分析：

1. 明确协助执行义务的性质
   根据《民事诉讼法》第249条及《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定（试行）》第45-51条，用人单位作为协助执行人，负有法定协助义务。若拒不配合，法院可对其处以罚款（个人5万元以下、单位5万-100万元），或对直接责任人员拘留；构成犯罪的（如隐匿财产），还可能追究刑事责任。

2. 分情况处理协助执行事项

   • 扣划工资/奖金
     若通知书要求冻结、扣划员工工资，用人单位需：
     ① 核对员工当前工资标准及应发金额；
     ② 保留当地最低生活保障标准（如当地月最低工资标准的80%）对应的金额，超出部分可协助扣划；
     ③ 在扣划后向员工出具书面说明，避免劳动纠纷。
     法律依据：《民事诉讼法》第250条、《最高人民法院关于适用〈民事诉讼法〉的解释》第501条。

   • 查封/扣押财产
     若要求查封员工在公司内的财产（如办公设备、车辆等），用人单位需：
     ① 立即停止员工对相关财产的使用；
     ② 配合法院清点、登记财产，并妥善保管；
     ③ 不得擅自转移、处分财产，否则需承担赔偿责任。
     风险提示：若财产实际归属公司（如公司配发的电脑），需及时向法院提出书面异议，避免被误执行。

   • 提供员工财产线索
     若要求提供员工收入、投资、债权等财产信息，用人单位需：
     ① 如实提供工资发放记录、社保缴纳记录等；
     ② 若涉及商业秘密（如客户名单），可要求法院保密或仅向申请执行人披露必要信息；
     ③ 不得伪造、隐匿证据，否则可能构成妨害诉讼。

3. 特殊情形处理

   • 员工已离职：若协助执行时员工已离职，用人单位需在收到通知书后立即书面告知法院，并附上离职证明、工资结算单等证据，避免被误认为协助隐匿财产。
     
   • 执行标的争议：若认为执行标的（如工资）存在争议（如员工主张加班费未结算），可向法院提出书面异议，但不得以此为由拒绝配合，需先履行协助义务再通过诉讼解决争议。
     
   • 多份协助执行通知冲突：若收到不同法院对同一员工的协助执行通知，需按法院级别高低或到案先后顺序处理，并及时向后续法院说明情况。

4. 后续义务
   协助执行完成后，用人单位需：
   ① 保留协助执行通知书、扣划凭证等文件至少3年；
   ② 若员工对协助执行有异议（如认为扣划金额错误），可引导其通过执行异议程序解决，用人单位无需直接处理；
   ③ 定期与法院沟通，确认执行程序是否终结，避免因未及时解冻账户等引发新纠纷。

温馨提示：协助执行是用人单位的法定义务，但若对执行事项有疑问（如执行范围、金额计算等），可要求法院出具详细说明或联系执行法官沟通，避免因误解导致法律风险。如有具体案件需要分析，可直接向我咨询。