结论前置：招标人是否可以不扣除投标保证金，取决于中标人和招标人各自的责任性质、责任大小以及合同中的具体约定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定优先：

   • 在招标文件中，通常会明确规定投标保证金的扣除条件和情形。如果合同中明确规定了在中标人和招标人都有责任的情况下，招标人有权选择不扣除投标保证金，或者规定了具体的扣除比例和方式，那么招标人应按照合同约定执行。
   • 法律背景：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，招标文件是招标活动的法律依据，对招标人和投标人均具有约束力。因此，合同中的约定是判断招标人是否可以扣除投标保证金的首要依据。

2. 责任性质与大小：

   • 如果中标人和招标人的责任性质不同，或者责任大小有显著差异，招标人可能会根据责任情况决定是否扣除投标保证金。例如，如果中标人的责任是主要的，而招标人的责任是次要的或无关紧要的，招标人可能会选择扣除全部或部分投标保证金。
   • 反之，如果招标人的责任较大，或者中标人的责任较小且已得到妥善解决，招标人可能会选择不扣除投标保证金，以体现公平和合理的原则。
   • 法律建议：在处理此类纠纷时，应详细分析中标人和招标人的责任性质、责任大小以及因果关系，以确定双方应承担的责任比例。

3. 双方协商与和解：

   • 在中标人和招标人都有责任的情况下，双方也可以通过协商达成和解协议，就投标保证金的扣除问题达成一致意见。这种方式可以避免法律纠纷，节省时间和成本。
   • 法律后果：如果双方能够达成和解协议，并按照协议履行各自的责任和义务，那么招标人是否扣除投标保证金的问题将得到妥善解决。如果双方无法达成和解协议，则可能需要通过法律途径解决纠纷。

4. 法律程序与裁决：

   • 如果双方无法就投标保证金的扣除问题达成一致意见，且合同中没有明确规定或规定不明确，那么任何一方都可以向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。
   • 法律程序：在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据相关法律法规、合同条款以及双方提供的证据和事实情况，对招标人是否可以扣除投标保证金的问题进行裁决。

进一步思考：在实际操作中，为了避免类似纠纷的发生，招标人和中标人应在招标文件中明确规定投标保证金的扣除条件和情形，并在合同中详细约定双方的责任和义务。同时，在招标过程中，双方应严格遵守相关法律法规和合同条款，确保招标活动的公平、公正和透明。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。