当工厂体检结果不合格时，处理的方式主要取决于体检的具体类型和不合格的原因。以下是一些详细且有针对性的建议：

一、明确体检类型

首先，需要明确这次体检是职业健康体检还是常规的健康体检。

1. 职业健康体检：这是针对从事接触职业病危害作业的劳动者进行的体检，旨在筛查职业病、疑似职业病及职业禁忌。如果体检结果不合格，且涉及职业病或疑似职业病，那么处理方式将更为严格和特殊。

2. 常规健康体检：这是为了了解员工整体健康状况而进行的体检。如果体检结果不合格，可能只是表明员工在某些健康指标上存在问题，但不一定与职业病直接相关。

二、针对职业健康体检不合格的处理

如果体检是职业健康体检，且结果不合格，那么根据体检结论的不同，处理方式也会有所不同：

1. 目前未见异常但存在单项或多项异常：

   • 用人单位应按照职业健康检查机构要求的时间，安排员工进行复查和医学观察。
   • 密切关注员工的健康状况，确保工作环境符合职业健康标准。

2. 疑似职业病：

   • 用人单位需要立即按照职业健康检查机构的建议，安排员工进行医学观察或者职业病诊断，并承担相关费用。
   • 在此期间，不得解除或终止与员工的劳动合同，确保员工的合法权益。
   • 如果确诊为职业病，用人单位应依法承担相应的赔偿责任，并改善工作环境，防止类似情况再次发生。

3. 职业禁忌：

   • 对于有职业禁忌的员工，用人单位应将其调离或者暂时脱离原工作岗位，不得安排其从事相关接触职业病危害因素的工作。
   • 为员工提供必要的健康保护和康复措施，确保其健康不受进一步损害。

三、针对常规健康体检不合格的处理

如果体检是常规健康体检，且结果不合格，那么处理方式可能相对灵活：

1. 建议员工到综合性医院进一步复查诊治：

   • 对于体检中发现的非职业病相关疾病或异常，建议员工到综合性医院进行进一步检查和治疗。
   • 用人单位可以提供必要的支持和协助，如安排休假、提供医疗咨询等。

2. 根据员工健康状况调整工作岗位或工作内容：

   • 如果员工的健康状况可能影响其工作表现或安全，用人单位可以考虑调整其工作岗位或工作内容，以确保工作安全和效率。

四、加强职业健康管理和预防

无论体检类型如何，用人单位都应加强职业健康管理和预防工作：

1. 定期组织职业健康体检：

   • 确保员工定期接受职业健康体检，及时发现和处理职业健康问题。

2. 改善工作环境和条件：

   • 优化工作流程和布局，减少员工接触职业病危害因素的机会。
   • 提供必要的个人防护装备和设施，确保员工的健康和安全。

3. 加强职业健康教育和培训：

   • 提高员工对职业健康的认识和重视程度，增强其自我保护意识和能力。

综上所述，当工厂体检结果不合格时，用人单位应根据体检类型和不合格原因采取相应的处理措施，并加强职业健康管理和预防工作，确保员工的健康和安全。