卫生部（现为国家卫生健康委员会）制定的行政法规可以设定行政处罚，但需严格遵循《行政处罚法》的授权范围与程序要求。以下从法律授权、设定权限、程序要求三个角度展开分析：

1. 法律授权依据

根据《行政处罚法》第12条，国务院部委制定的行政法规（部门规章）可以在法律、行政法规规定的给予行政处罚的行为、种类和幅度范围内作出具体规定。若法律、行政法规未明确规定处罚事项，部门规章需满足以下条件方可设定处罚：

• 尚未制定法律、行政法规：即针对某一领域的管理需求，尚无上位法规范；
• 限于警告、通报批评或一定数额罚款：部门规章无权设定吊销许可证、责令停产停业等更严厉的处罚。

示例：若《传染病防治法》未规定“未按规定报告疫情”的处罚，国家卫生健康委员会可通过部门规章设定警告或罚款，但罚款限额需符合《行政处罚法》第35条规定的“通常标准”（如对公民处200元以下、对法人处3000元以下，但法律另有规定的除外）。

2. 设定权限的边界

卫生部行政法规设定处罚时，需严格区分行政法规与部门规章的权限：

• 行政法规（由国务院制定）：可依据《行政处罚法》第10条，在尚未制定法律的情况下，设定除限制人身自由以外的行政处罚（如罚款、没收违法所得、责令停产停业等）。
• 部门规章（由部委制定）：仅能在上位法范围内细化规定，或在没有上位法时设定警告、通报批评或限额罚款。

关键区分：若用户问题中的“卫生部行政法规”实际指部门规章（如《医疗机构管理条例实施细则》），则其处罚设定权受限；若指国务院制定的行政法规（如《传染病防治法实施办法》），则权限更广。

3. 程序合法性要求

即使有权设定处罚，卫生部行政法规还需满足以下程序要求：

• 公开征求意见：根据《立法法》第67条，制定行政法规需广泛征求意见，必要时召开听证会；
• 不与上位法冲突：不得超越《行政处罚法》或《基本医疗卫生与健康促进法》等法律的授权范围；
• 备案审查：行政法规发布后需报国务院备案，部门规章需报国务院备案并接受合法性审查。

4. 实践中的常见问题

• 越权设定处罚：若部门规章超出警告、罚款范围设定处罚（如设定“暂扣执业证书”），可能因违反《行政处罚法》第12条被认定无效；
• 处罚幅度不当：若罚款数额超过法律规定的“通常标准”且无法律特别授权，可能被撤销（参考《行政处罚法》第35条）。

建议

若您遇到卫生部行政法规设定的处罚争议，建议从以下角度核查：

1. 确认该文件性质（行政法规/部门规章）；
2. 核查上位法是否已规定处罚事项；
3. 核对处罚种类与幅度是否符合《行政处罚法》授权。

如有具体案件或文件需分析，可直接向我咨询，我将结合条文与案例进一步解答。