在不知情的情况下运输保护动物，虽然主观上无恶意，但若不能充分证明“不知情”，则仍可能面临法律责任；若确能证明“不知情”，则可避免刑事处罚，但仍可能受到行政处罚。以下从刑事和行政两个层面为你详细分析：

一、刑事层面

1. 构成要件：构成非法运输珍贵、濒危野生动物及其制品罪，要求行为人主观上具有故意。这意味着，如果你能证明自己确实不知情，即不符合该罪的主观构成要件，通常不会被认定构成此罪。

2. 不知情认定：“不知情”的认定较为严格，需有充分证据支撑。例如，你可以提供运输来源渠道正规的证明、相关合法手续、运输过程中的合理认知等证据，来证明自己确实不知情。

3. 法律后果：若能证明不知情，则可避免有期徒刑、拘役及罚金等刑事处罚。

二、行政层面

1. 行政责任：即使主观上不知情，但客观上违反了《野生动物保护法》等相关法律法规，因此仍需承担行政责任。相关部门可能会依据法律法规对运输的动物予以收缴，并根据具体情况给予警告、罚款等行政处罚。

2. 罚款标准：罚款是常见的行政处罚方式，金额一般根据运输的动物数量、种类及情节严重程度确定。通常每只动物罚款在150-300元不等。若你因运输获得经济收益，还会被没收违法所得。

3. 其他处罚：在特定情况下，如运输数量巨大、种类特别珍贵或造成严重后果，你可能面临更严厉的处罚，甚至包括拘留等。

三、特殊情况处理与减轻处罚

• 如果你能够充分证明自己在运输过程中确实不知情，并且积极配合相关部门的调查处理，可能会在一定程度上减轻处罚。配合态度、是否主动改正错误等因素，在处罚决定中也会予以考虑。

四、建议与提醒

1. 加强法律法规学习：从事动物运输的单位和个人应深入学习野生动物保护相关法律法规，确保自身行为合法合规。

2. 严格核实货物信息：在运输前，务必严格核实货物信息，特别是动物种类和来源，确保不涉及国家重点保护的珍贵、濒危野生动物。

3. 积极应对与配合：一旦涉嫌非法运输，应立即停止违法行为，并积极配合相关部门的调查处理，如实陈述事实，以争取从轻或减轻处罚。

综上所述，虽然不知情可能在一定程度上减轻法律责任，但并非完全免责。从事动物运输的单位和个人应时刻保持警惕，严格遵守法律法规，确保自身行为的合法性。如果你在运输过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。