结论：只发现违法行为但没有发现违法行为人，且超过行政处罚时效的，一般情况下行政机关将不再给予行政处罚。但具体是否处罚，还需根据违法行为的性质及法律规定来判断。

详细分析：

1. 一般规定下的处罚时效：

   • 根据《行政处罚法》的相关规定，对于大多数违法行为，若其在二年内未被行政机关发现（这里的“发现”特指行政机关发现违法行为的线索并开始启动调查程序等情况），那么此后将不再给予行政处罚。这意味着，如果违法行为已经超过了二年的处罚时效，且在这期间行政机关并未发现相关线索，那么即使后来发现了该违法行为，行政机关也不再对其进行处罚。

2. 特殊情况下的处罚时效延长：

   • 然而，并非所有情况都适用上述二年期限。特别是当违法行为涉及公民生命健康安全、金融安全且产生了危害后果时，该“未发现”的期限会延长至五年。这意味着，在这类严重违法行为发生后五年内，只要行政机关发现了相关线索，仍然可以对违法者进行行政处罚。

3. 处罚时效的计算方式：

   • 处罚时效是从违法行为发生之日起计算。如果违法行为是连续或持续进行的，那么期限将从行为终了之日起开始计算。这一点对于确定是否超过处罚时效至关重要。例如，如果某违法行为持续了三年，那么处罚时效将从该行为结束之日起计算二年或五年（根据违法行为的性质而定）。

4. 未发现违法行为人的影响：

   • 在您提到的情况下，虽然只发现了违法行为但没有发现违法行为人，但这并不影响处罚时效的计算。处罚时效的计算是基于违法行为的发生时间，而不是基于违法行为人的发现时间。因此，即使违法行为人尚未被发现，只要违法行为已经超过了处罚时效，行政机关就不再对其进行处罚。

5. 法律建议：

   • 尽管存在处罚时效的规定，但并不意味着可以随意违法。因为一旦违法行为被发现并受到处罚，不仅可能面临经济上的损失，还可能对个人声誉、职业发展等造成严重影响。因此，我建议您无论在任何情况下都要遵守法律法规，避免不必要的麻烦和风险。

举例说明：

假设某企业在2020年1月1日实施了一项违法行为（该行为不涉及公民生命健康安全、金融安全且未产生危害后果），但行政机关在2023年1月2日才发现该违法行为的线索并开始启动调查程序。由于该违法行为已经超过了二年的处罚时效（从2020年1月1日起计算至2022年12月31日止），因此行政机关将不再对该企业进行行政处罚。

进一步思考：

• 如果您对处罚时效的计算方式或特定违法行为的处罚时效有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况给出更详细的解答。
• 同时，我也建议您关注相关法律法规的更新和变化，以便及时了解最新的法律动态和规定。