协议扫描件签字在一定条件下具有法律效力，但具体效力需根据双方约定、真实意思表示、法律要求以及证据佐证等因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律效力条件
双方明确约定：
- 若协议双方在签署扫描件时明确约定其具有与原件同等的法律效力，并且不存在欺诈、胁迫等导致合同无效的情形，那么该扫描件签字是有效的。此约定应体现双方的真实意愿，且不违反法律法规的强制性规定。
真实意思表示：
- 扫描件签字需反映双方的真实意思表示。若能通过技术手段（如笔迹鉴定、电子签名验证技术）或其他可靠方式（如双方确认、见证人证言）证明扫描件与原件一致，且双方在签署过程中均表达了真实意愿，则可认定扫描件签字具有法律效力。
符合法律要求：
- 签名者需具备相应的民事行为能力，即具有签署协议的法律能力。
- 签名必须真实，无伪造或篡改。若扫描件经过了可靠的电子签名认证，符合《电子签名法》规定的可靠电子签名条件，那么它在法律上具有与手写签名或盖章同等的效力。
- 协议内容不得违反法律法规和公序良俗。
能够与原件核对无误：
- 如果扫描件的签字和内容能够通过技术手段或其他可靠方式与原件进行核对，并确认一致，那么该扫描件签字具有与原件同等的法律效力。
有其他证据佐证：
- 当扫描件本身证明力有限时，若有其他相关证据（如付款凭证、交货记录、沟通记录等）能够形成完整的证据链，佐证扫描件的真实性和双方的履行情况，则扫描件签字也可被认定具有法律效力。
二、法律效力证明
签名验证：
- 为确保签名的真实性，可通过专业机构进行笔迹鉴定或使用电子签名验证技术。
内容一致性比对：
- 需详细比对扫描件与原件的文本、格式、签名等细节，以证明两者内容完全一致。
双方认可：
- 如果协议双方对扫描件内容无异议，并明确认可其法律效力，那么该扫描件签字在双方之间将具有约束力。
三、风险提示与建议
风险提示：
- 尽管在满足特定条件下，协议扫描件签字具有法律效力，但从法律风险防控角度考虑，扫描件作为图片存在，技术上存在被篡改的风险。
- 在发生合同纠纷时，仅依赖扫描件作为证据可能难以充分证明双方当时的合议，从而影响权益保障。
建议：
- 优先采用书面原件：为确保合同的严谨性和双方权益的最大化保护，建议在签订合同时优先考虑使用书面原件，并妥善保管合同原件。
- 增强证明力：在必要时可采取技术措施（如电子签名认证）或其他辅助手段（如公证、见证）来增强扫描件签字的证明力和可信度。
- 了解法律法规：在使用协议扫描件之前，应详细了解相关法律法规和合同条款的具体要求，确保扫描件的使用符合法律规定。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，并约定可以通过扫描件形式进行签署和确认。合同签署后，甲方将扫描件发送给乙方，乙方确认无误后回复邮件表示接受。在此情况下，若该扫描件真实反映了原件内容，且双方均表达了真实意愿，同时符合相关法律法规的要求，那么该扫描件签字即具有法律效力。若后续发生纠纷，该扫描件可作为有效证据使用。
综上所述，协议扫描件签字在一定条件下确实具有法律效力，但为确保合同的严谨性和双方权益的最大化保护，建议优先采用书面原件方式签订合同。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。