结论：仓库发错货扣员工工资这一行为是否合法，需根据具体情况判断。一般来说，如果错误发货是由于员工的故意或重大过失导致的，且公司规章制度中有明确规定，那么公司可能有权扣除部分工资作为赔偿；但如果错误发货并非员工故意或重大过失，或者公司规章制度中没有相关规定，那么公司无权随意扣除员工工资。
分析说明：
员工故意或重大过失的情况：
- 如果员工在发货过程中存在故意或重大过失，如疏忽大意、违反操作规程等，导致仓库发错货，且这一行为给公司造成了经济损失，那么公司有权根据规章制度或劳动合同中的约定，要求员工承担相应的赔偿责任。
- 在这种情况下，公司扣除员工工资作为赔偿是合理的，但扣除的金额应当合理，且不得超过员工当月工资的20%（根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%）。
员工非故意或重大过失的情况：
- 如果错误发货并非员工故意或重大过失导致的，而是由于系统故障、信息错误、管理疏忽等非员工个人原因造成的，那么公司无权将责任完全归咎于员工，并扣除其工资。
- 在这种情况下，公司应当承担相应的管理责任，并采取措施防止类似事件再次发生，而不是通过扣除员工工资来转嫁风险。
公司规章制度的规定：
- 公司规章制度是员工行为的重要准则，也是公司管理员工的重要依据。如果公司规章制度中明确规定了因员工原因导致仓库发错货时的赔偿责任和扣除工资的具体标准，那么公司有权按照规章制度执行。
- 但需要注意的是，公司规章制度必须合法合规，且经过民主程序制定并公示，否则可能无法作为扣除员工工资的依据。
法律建议：
- 对于员工：如果公司因仓库发错货而扣除你的工资，你应当首先了解公司规章制度中是否有相关规定，并判断自己是否存在故意或重大过失。如果你认为公司扣除工资的行为不合理或违法，你可以与公司协商解决，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
- 对于公司：公司应当建立健全的规章制度，明确员工在发货过程中的职责和义务，以及因员工原因导致仓库发错货时的赔偿责任和扣除工资的具体标准。同时，公司应当加强对员工的培训和管理，提高员工的业务水平和责任意识，减少类似事件的发生。
后续行动指南：
- 如果你作为员工遇到此类问题，建议先与公司沟通，了解扣除工资的具体原因和依据，并保留好相关证据（如工资条、规章制度、工作记录等）。
- 如果沟通无果或你认为公司行为违法，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 如果你作为公司管理者遇到此类问题，建议审查公司规章制度是否合法合规，并加强对员工的培训和管理，以减少类似事件的发生和降低公司的法律风险。