协议只有复印件，其法律效力并非绝对，而是需根据具体情况综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、从证据效力的角度
证明力有限：
- 复印件作为证据时，其证明力相对较弱。在法律程序中，原件通常被视为最直接、最可靠的证据。如果一方仅能提供复印件，而另一方对复印件的真实性提出异议，且没有其他证据佐证，法院可能不会认可该复印件的证明力。
需结合其他证据：
- 在某些情况下，如果复印件能够与其他间接证据（如证人证言、电子邮件记录、履行协议的付款凭证等）相互印证，形成完整的证据链，那么复印件可能会在一定程度上被法院采纳。例如，在合同纠纷中，如果双方通过电子邮件确认了合同内容，并且这些邮件内容与复印件上的条款一致，那么复印件的证明力会得到增强。
二、从协议双方约定的角度
- 双方认可效力：
- 如果协议双方在协议中明确约定复印件具有与原件同等的法律效力，且该约定不违反法律法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益，那么协议复印件在此情况下是有效的。
三、从协议成立与生效的角度
- 原件协议已成立生效：
- 若协议原件已经满足合同成立和生效的要件（如双方当事人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律和行政法规的强制性规定等），则复印件虽然证明力较弱，但仍可以反映出原件协议的内容。在证明复印件与原件内容一致时，复印件可以作为证明协议关系存在及内容的材料。
四、特殊规定或约定
- 根据相关法律规定：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，书证应当提交原件，但在某些特殊情况下，如原件遗失、毁损等，可以提供与原件核对无误的复制件。如果协议中明确规定了复印件的效力，或者法律有特别规定复印件在某些情况下具有与原件同等的法律效力，那么复印件也可以被视为有效。
五、法律建议
及时采取措施：
- 一旦发现协议原件丢失或无法获取，应立即采取补救措施，如尝试找回原件、与对方协商补签协议或确认复印件的效力等。
保留相关证据：
- 保留与协议相关的所有证据，包括复印件、电子邮件记录、证人证言等，以备不时之需。这些证据可以在争议解决过程中起到关键作用。
增强复印件的证明力：
- 如果可能的话，可以通过公证、律师见证等方式增强复印件的证明力。这些方式可以提供额外的保障，使复印件在法律程序中更具说服力。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，但原件不慎丢失。甲只能提供合同的复印件作为证据。如果乙对复印件的真实性提出异议，甲可以尝试提供其他证据来佐证复印件的真实性，如双方交易过程中的电子邮件、短信记录、付款凭证等。如果这些证据能够与复印件相互印证，形成完整的证据链，那么法院可能会采信复印件作为认定案件事实的依据。
综上所述，协议只有复印件时，其法律效力需根据具体情况综合判断。在实际操作中，建议尽量保存好协议的原件，并在只能提供复印件时采取必要的措施来增强其证明力。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。