关于员工在行政拘留期间工资如何发放的问题，这确实是一个涉及劳动合同、用人单位规章制度以及法律法规的综合考量点。以下是我为您详细梳理的解答：
一、一般原则
首先，从法律层面来看，行政拘留并非因员工履行工作职责而受到的处罚，也不属于刑事处罚。因此，在劳动合同没有特别约定，且用人单位规章制度也未明确规定在行政拘留期间扣发工资的情况下，用人单位应当按照正常出勤向员工发放工资。这是因为，尽管员工因个人行为被限制了人身自由，但其与用人单位的劳动关系依然存续，劳动权并未丧失。
二、有约定或规定时的处理
劳动合同中的约定：
- 如果劳动合同中有明确条款规定，员工在行政拘留期间工资停发或减发，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以按照合同约定执行。
用人单位规章制度的规定：
- 如果用人单位依法制定并公示了规章制度，且该规章制度中有关于员工被行政拘留期间工资处理的规定，同时规章制度的制定程序合法、内容合理，那么用人单位也可以依据规章制度来决定工资的发放情况。
三、实操中的常见做法与特殊情况
常见做法：
- 在实际操作中，多数用人单位可能会选择在员工被行政拘留期间停发工资、福利及待遇，并中止履行劳动合同的其他义务，如社保缴费等。待员工结束拘留回到工作岗位后，再恢复其工资待遇并继续履行合同。但这种做法并非绝对，需根据具体情况和合同约定来判断。
特殊情况：
- 如果员工能证明其被错误限制人身自由，或最终被判无罪释放，那么在此期间，用人单位应按员工原标准支付工资，并补发被拘留期间的工资。这是为了保障员工的合法权益，避免因错误拘留而遭受经济损失。
四、建议与指导
对用人单位的建议：
- 为避免后续纠纷，建议用人单位在制定劳动合同时，就明确员工被行政拘留等特殊情况的处理方式。同时，确保规章制度的制定程序合法、内容合理，并依法进行公示，以便员工了解和遵守。
对员工的指导：
- 员工应了解自己的权益和义务，在面临类似情况时能够做出正确的判断和处理。如果用人单位随意克扣被行政拘留员工的工资，员工有权与用人单位协商要求支付工资；协商不成的，可以通过劳动监察投诉、劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，员工在行政拘留期间的工资发放问题需要根据实际情况和合同约定来判断。用人单位和员工都应充分了解相关法律法规和权利义务，以确保在处理此类问题时能够做到合法合规、公平公正。希望这个解答能对您有所帮助。