员工被行政拘留期间工资的发放需依据劳动合同、用人单位规章制度以及具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的工资发放原则
从法律层面来看，行政拘留并非因员工履行工作职责而受到的处罚，也不属于刑事处罚。因此，在员工与用人单位签订的劳动合同中没有特别约定，且用人单位规章制度也未明确规定在行政拘留期间扣发工资的情况下，用人单位应当按照正常出勤向员工发放工资。这是因为员工虽因个人行为被限制人身自由，但其劳动权并未丧失，与用人单位的劳动关系依然存续。
二、有相关约定或规定时的处理方式
劳动合同中的约定：
- 若劳动合同中有明确条款规定员工被行政拘留期间工资停发或减发，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以按照合同约定执行。
用人单位规章制度的规定：
- 若用人单位依法制定并公示了规章制度，且该规章制度中有关于员工被行政拘留期间工资处理的规定，同时规章制度的制定程序合法、内容合理，则用人单位也可以按照规章制度来决定工资的发放情况。
三、实操中的常见做法与特殊情况
常见做法：
- 在实践中，多数用人单位会选择在员工被行政拘留期间停发工资、福利及待遇，并中止履行劳动合同的其他义务，如社保缴费等。待员工结束拘留回到工作岗位后，再恢复其工资待遇并继续履行合同。但这种做法可能存在一定的法律风险，如果劳动合同或规章制度中没有明确规定，用人单位可能面临支付工资的法律责任。
特殊情况：
- 若员工能证明其被错误限制人身自由，或最终被判无罪释放，那么在此期间，用人单位应按员工原标准支付工资，并补发被拘留期间的工资。这是因为员工在此期间并未因违法行为而丧失劳动权，且可能因错误限制人身自由而遭受损失。
四、对用人单位和员工的建议
对用人单位的建议：
- 为避免后续纠纷，建议用人单位在制定劳动合同时，就明确员工被行政拘留等特殊情况的处理方式。同时，确保规章制度的制定程序合法、内容合理，并依法进行公示。这样可以在发生纠纷时，为用人单位提供有力的法律支持。
对员工的指导：
- 员工应了解自己的权益和义务，在面临类似情况时能够做出正确的判断和处理。若用人单位随意克扣被行政拘留员工的工资，员工有权与用人单位协商要求支付工资；协商不成的，可以通过劳动监察投诉、劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。
总结来说，员工被行政拘留期间的工资发放问题需要根据实际情况和合同约定来判断。用人单位和员工都应充分了解相关法律法规和权利义务，以确保在处理此类问题时能够做到合法合规、公平公正。如果你或你身边的人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。